Protein–RNA interactions for Protein: P81133

SIM1, Single-minded homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIM1P81133 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SIM1P81133 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SIM1P81133 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SIM1P81133 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SIM1P81133 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SIM1P81133 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SIM1P81133 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SIM1P81133 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SIM1P81133 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SIM1P81133 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SIM1P81133 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SIM1P81133 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SIM1P81133 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SIM1P81133 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SIM1P81133 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SIM1P81133 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SIM1P81133 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SIM1P81133 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SIM1P81133 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SIM1P81133 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SIM1P81133 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SIM1P81133 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SIM1P81133 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SIM1P81133 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SIM1P81133 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SIM1P81133 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SIM1P81133 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SIM1P81133 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SIM1P81133 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SIM1P81133 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SIM1P81133 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SIM1P81133 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SIM1P81133 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SIM1P81133 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SIM1P81133 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SIM1P81133 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SIM1P81133 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SIM1P81133 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SIM1P81133 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SIM1P81133 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SIM1P81133 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SIM1P81133 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SIM1P81133 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SIM1P81133 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SIM1P81133 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SIM1P81133 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SIM1P81133 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SIM1P81133 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SIM1P81133 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SIM1P81133 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SIM1P81133 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SIM1P81133 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SIM1P81133 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SIM1P81133 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SIM1P81133 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SIM1P81133 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SIM1P81133 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SIM1P81133 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SIM1P81133 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SIM1P81133 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SIM1P81133 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SIM1P81133 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SIM1P81133 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SIM1P81133 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SIM1P81133 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SIM1P81133 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SIM1P81133 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SIM1P81133 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
SIM1P81133 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SIM1P81133 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SIM1P81133 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SIM1P81133 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SIM1P81133 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SIM1P81133 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SIM1P81133 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SIM1P81133 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SIM1P81133 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SIM1P81133 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SIM1P81133 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SIM1P81133 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SIM1P81133 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SIM1P81133 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SIM1P81133 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SIM1P81133 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SIM1P81133 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SIM1P81133 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SIM1P81133 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SIM1P81133 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SIM1P81133 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SIM1P81133 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SIM1P81133 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SIM1P81133 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SIM1P81133 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SIM1P81133 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SIM1P81133 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SIM1P81133 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SIM1P81133 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SIM1P81133 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SIM1P81133 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SIM1P81133 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms