Protein–RNA interactions for Protein: P81069

Gabpb2, GA-binding protein subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb2P81069 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Gabpb2P81069 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Gabpb2P81069 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Gabpb2P81069 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Gabpb2P81069 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Gabpb2P81069 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Gabpb2P81069 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Gabpb2P81069 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Gabpb2P81069 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Gabpb2P81069 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Gabpb2P81069 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Gabpb2P81069 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Gabpb2P81069 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Gabpb2P81069 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Gabpb2P81069 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Gabpb2P81069 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Gabpb2P81069 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Gabpb2P81069 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Gabpb2P81069 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Gabpb2P81069 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Gabpb2P81069 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Gabpb2P81069 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Gabpb2P81069 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Gabpb2P81069 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Gabpb2P81069 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Gabpb2P81069 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Gabpb2P81069 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Gabpb2P81069 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Gabpb2P81069 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Gabpb2P81069 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Gabpb2P81069 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Gabpb2P81069 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Gabpb2P81069 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Gabpb2P81069 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gabpb2P81069 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Gabpb2P81069 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Gabpb2P81069 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gabpb2P81069 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gabpb2P81069 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gabpb2P81069 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gabpb2P81069 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gabpb2P81069 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Gabpb2P81069 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Gabpb2P81069 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Gabpb2P81069 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Gabpb2P81069 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Gabpb2P81069 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Gabpb2P81069 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Gabpb2P81069 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Gabpb2P81069 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gabpb2P81069 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Gabpb2P81069 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gabpb2P81069 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gabpb2P81069 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gabpb2P81069 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Gabpb2P81069 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Gabpb2P81069 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gabpb2P81069 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Gabpb2P81069 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Gabpb2P81069 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gabpb2P81069 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gabpb2P81069 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gabpb2P81069 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gabpb2P81069 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Gabpb2P81069 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gabpb2P81069 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gabpb2P81069 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gabpb2P81069 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gabpb2P81069 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gabpb2P81069 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gabpb2P81069 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gabpb2P81069 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Gabpb2P81069 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gabpb2P81069 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gabpb2P81069 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Gabpb2P81069 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Gabpb2P81069 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Gabpb2P81069 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gabpb2P81069 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Gabpb2P81069 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gabpb2P81069 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gabpb2P81069 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gabpb2P81069 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gabpb2P81069 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gabpb2P81069 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Gabpb2P81069 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Gabpb2P81069 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gabpb2P81069 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gabpb2P81069 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gabpb2P81069 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Gabpb2P81069 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Gabpb2P81069 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Gabpb2P81069 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Gabpb2P81069 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Gabpb2P81069 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Gabpb2P81069 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Gabpb2P81069 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Gabpb2P81069 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gabpb2P81069 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gabpb2P81069 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms