Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Irx2P81066 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Irx2P81066 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Irx2P81066 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Irx2P81066 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Irx2P81066 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Irx2P81066 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Irx2P81066 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Irx2P81066 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Irx2P81066 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Irx2P81066 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Irx2P81066 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Irx2P81066 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Irx2P81066 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Irx2P81066 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Irx2P81066 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Irx2P81066 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Irx2P81066 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Irx2P81066 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Irx2P81066 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Irx2P81066 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Irx2P81066 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Irx2P81066 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Irx2P81066 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Irx2P81066 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Irx2P81066 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Irx2P81066 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Irx2P81066 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Irx2P81066 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Irx2P81066 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Irx2P81066 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Irx2P81066 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Irx2P81066 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Irx2P81066 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Irx2P81066 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Irx2P81066 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Irx2P81066 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Irx2P81066 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Irx2P81066 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Irx2P81066 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Irx2P81066 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Irx2P81066 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Irx2P81066 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Irx2P81066 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Irx2P81066 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Irx2P81066 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Irx2P81066 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Irx2P81066 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Irx2P81066 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Irx2P81066 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Irx2P81066 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Irx2P81066 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Irx2P81066 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Irx2P81066 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Irx2P81066 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Irx2P81066 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Irx2P81066 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Irx2P81066 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Irx2P81066 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Irx2P81066 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Irx2P81066 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Irx2P81066 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Irx2P81066 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Irx2P81066 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Irx2P81066 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Irx2P81066 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Irx2P81066 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Irx2P81066 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Irx2P81066 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Irx2P81066 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Irx2P81066 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Irx2P81066 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Irx2P81066 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Irx2P81066 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Irx2P81066 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Irx2P81066 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Irx2P81066 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Irx2P81066 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Irx2P81066 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Irx2P81066 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Irx2P81066 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Irx2P81066 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Irx2P81066 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Irx2P81066 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Irx2P81066 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Irx2P81066 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Irx2P81066 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Irx2P81066 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Irx2P81066 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Irx2P81066 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Irx2P81066 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Irx2P81066 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Irx2P81066 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Irx2P81066 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Irx2P81066 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Irx2P81066 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Irx2P81066 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Irx2P81066 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Irx2P81066 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Irx2P81066 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.9 ms