Protein–RNA interactions for Protein: P78426

NKX6-1, Homeobox protein Nkx-6.1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX6-1P78426 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
NKX6-1P78426 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
NKX6-1P78426 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
NKX6-1P78426 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NKX6-1P78426 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
NKX6-1P78426 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
NKX6-1P78426 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NKX6-1P78426 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NKX6-1P78426 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NKX6-1P78426 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NKX6-1P78426 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NKX6-1P78426 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NKX6-1P78426 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NKX6-1P78426 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NKX6-1P78426 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NKX6-1P78426 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NKX6-1P78426 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NKX6-1P78426 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NKX6-1P78426 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NKX6-1P78426 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NKX6-1P78426 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NKX6-1P78426 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NKX6-1P78426 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NKX6-1P78426 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NKX6-1P78426 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NKX6-1P78426 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NKX6-1P78426 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NKX6-1P78426 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NKX6-1P78426 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NKX6-1P78426 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NKX6-1P78426 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NKX6-1P78426 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NKX6-1P78426 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NKX6-1P78426 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NKX6-1P78426 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NKX6-1P78426 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NKX6-1P78426 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NKX6-1P78426 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NKX6-1P78426 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NKX6-1P78426 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NKX6-1P78426 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NKX6-1P78426 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NKX6-1P78426 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NKX6-1P78426 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NKX6-1P78426 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NKX6-1P78426 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NKX6-1P78426 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NKX6-1P78426 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NKX6-1P78426 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NKX6-1P78426 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NKX6-1P78426 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NKX6-1P78426 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NKX6-1P78426 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NKX6-1P78426 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NKX6-1P78426 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NKX6-1P78426 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NKX6-1P78426 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NKX6-1P78426 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NKX6-1P78426 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NKX6-1P78426 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NKX6-1P78426 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NKX6-1P78426 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NKX6-1P78426 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NKX6-1P78426 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NKX6-1P78426 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NKX6-1P78426 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NKX6-1P78426 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NKX6-1P78426 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NKX6-1P78426 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NKX6-1P78426 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NKX6-1P78426 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NKX6-1P78426 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NKX6-1P78426 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NKX6-1P78426 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NKX6-1P78426 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NKX6-1P78426 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NKX6-1P78426 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NKX6-1P78426 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NKX6-1P78426 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NKX6-1P78426 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NKX6-1P78426 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NKX6-1P78426 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NKX6-1P78426 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NKX6-1P78426 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NKX6-1P78426 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NKX6-1P78426 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NKX6-1P78426 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NKX6-1P78426 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NKX6-1P78426 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NKX6-1P78426 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NKX6-1P78426 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NKX6-1P78426 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NKX6-1P78426 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NKX6-1P78426 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NKX6-1P78426 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NKX6-1P78426 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NKX6-1P78426 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NKX6-1P78426 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NKX6-1P78426 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NKX6-1P78426 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms