Protein–RNA interactions for Protein: P70441

Slc9a3r1, Na(+)/H(+) exchange regulatory cofactor NHE-RF1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9a3r1P70441 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc9a3r1P70441 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc9a3r1P70441 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc9a3r1P70441 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc9a3r1P70441 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc9a3r1P70441 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc9a3r1P70441 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc9a3r1P70441 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc9a3r1P70441 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc9a3r1P70441 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc9a3r1P70441 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc9a3r1P70441 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc9a3r1P70441 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc9a3r1P70441 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc9a3r1P70441 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc9a3r1P70441 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc9a3r1P70441 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc9a3r1P70441 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc9a3r1P70441 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc9a3r1P70441 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc9a3r1P70441 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc9a3r1P70441 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc9a3r1P70441 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc9a3r1P70441 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc9a3r1P70441 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc9a3r1P70441 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc9a3r1P70441 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc9a3r1P70441 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc9a3r1P70441 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc9a3r1P70441 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc9a3r1P70441 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc9a3r1P70441 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc9a3r1P70441 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc9a3r1P70441 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc9a3r1P70441 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc9a3r1P70441 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc9a3r1P70441 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc9a3r1P70441 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc9a3r1P70441 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc9a3r1P70441 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc9a3r1P70441 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc9a3r1P70441 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc9a3r1P70441 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc9a3r1P70441 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc9a3r1P70441 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc9a3r1P70441 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc9a3r1P70441 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Slc9a3r1P70441 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc9a3r1P70441 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc9a3r1P70441 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc9a3r1P70441 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc9a3r1P70441 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc9a3r1P70441 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc9a3r1P70441 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc9a3r1P70441 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc9a3r1P70441 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc9a3r1P70441 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc9a3r1P70441 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc9a3r1P70441 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc9a3r1P70441 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc9a3r1P70441 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc9a3r1P70441 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc9a3r1P70441 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc9a3r1P70441 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc9a3r1P70441 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc9a3r1P70441 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc9a3r1P70441 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc9a3r1P70441 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc9a3r1P70441 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc9a3r1P70441 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc9a3r1P70441 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc9a3r1P70441 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc9a3r1P70441 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc9a3r1P70441 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc9a3r1P70441 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Slc9a3r1P70441 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Slc9a3r1P70441 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Slc9a3r1P70441 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc9a3r1P70441 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc9a3r1P70441 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc9a3r1P70441 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc9a3r1P70441 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc9a3r1P70441 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc9a3r1P70441 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc9a3r1P70441 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc9a3r1P70441 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc9a3r1P70441 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc9a3r1P70441 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc9a3r1P70441 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc9a3r1P70441 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc9a3r1P70441 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc9a3r1P70441 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc9a3r1P70441 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc9a3r1P70441 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc9a3r1P70441 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc9a3r1P70441 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc9a3r1P70441 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slc9a3r1P70441 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slc9a3r1P70441 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slc9a3r1P70441 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.6 ms