Protein–RNA interactions for Protein: P70426

Rit1, GTP-binding protein Rit1, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rit1P70426 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rit1P70426 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rit1P70426 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rit1P70426 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rit1P70426 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rit1P70426 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rit1P70426 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rit1P70426 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rit1P70426 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rit1P70426 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rit1P70426 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rit1P70426 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rit1P70426 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rit1P70426 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rit1P70426 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rit1P70426 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rit1P70426 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rit1P70426 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rit1P70426 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rit1P70426 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rit1P70426 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rit1P70426 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rit1P70426 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rit1P70426 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rit1P70426 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rit1P70426 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rit1P70426 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rit1P70426 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Rit1P70426 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rit1P70426 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Rit1P70426 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rit1P70426 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rit1P70426 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rit1P70426 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rit1P70426 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rit1P70426 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rit1P70426 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rit1P70426 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rit1P70426 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rit1P70426 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rit1P70426 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rit1P70426 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rit1P70426 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rit1P70426 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rit1P70426 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rit1P70426 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rit1P70426 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Rit1P70426 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rit1P70426 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Rit1P70426 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rit1P70426 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rit1P70426 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rit1P70426 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rit1P70426 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rit1P70426 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rit1P70426 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rit1P70426 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rit1P70426 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rit1P70426 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rit1P70426 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rit1P70426 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rit1P70426 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Rit1P70426 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rit1P70426 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rit1P70426 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rit1P70426 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rit1P70426 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rit1P70426 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rit1P70426 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rit1P70426 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rit1P70426 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rit1P70426 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rit1P70426 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rit1P70426 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rit1P70426 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rit1P70426 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rit1P70426 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rit1P70426 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rit1P70426 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rit1P70426 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rit1P70426 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rit1P70426 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Rit1P70426 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rit1P70426 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rit1P70426 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Rit1P70426 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rit1P70426 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rit1P70426 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rit1P70426 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rit1P70426 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rit1P70426 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rit1P70426 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rit1P70426 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rit1P70426 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Rit1P70426 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rit1P70426 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rit1P70426 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Rit1P70426 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rit1P70426 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rit1P70426 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms