Protein–RNA interactions for Protein: P70390

Shox2, Short stature homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shox2P70390 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Shox2P70390 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Shox2P70390 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Shox2P70390 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Shox2P70390 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Shox2P70390 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Shox2P70390 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Shox2P70390 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Shox2P70390 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Shox2P70390 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Shox2P70390 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Shox2P70390 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Shox2P70390 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Shox2P70390 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Shox2P70390 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Shox2P70390 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Shox2P70390 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Shox2P70390 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Shox2P70390 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Shox2P70390 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Shox2P70390 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Shox2P70390 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Shox2P70390 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Shox2P70390 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Shox2P70390 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Shox2P70390 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Shox2P70390 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Shox2P70390 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Shox2P70390 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Shox2P70390 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Shox2P70390 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Shox2P70390 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Shox2P70390 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Shox2P70390 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Shox2P70390 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Shox2P70390 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Shox2P70390 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Shox2P70390 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Shox2P70390 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Shox2P70390 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Shox2P70390 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Shox2P70390 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Shox2P70390 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Shox2P70390 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Shox2P70390 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Shox2P70390 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Shox2P70390 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Shox2P70390 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Shox2P70390 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Shox2P70390 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Shox2P70390 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Shox2P70390 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Shox2P70390 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Shox2P70390 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Shox2P70390 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Shox2P70390 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Shox2P70390 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Shox2P70390 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Shox2P70390 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Shox2P70390 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Shox2P70390 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Shox2P70390 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Shox2P70390 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Shox2P70390 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Shox2P70390 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Shox2P70390 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Shox2P70390 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Shox2P70390 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Shox2P70390 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Shox2P70390 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Shox2P70390 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Shox2P70390 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Shox2P70390 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Shox2P70390 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Shox2P70390 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Shox2P70390 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Shox2P70390 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Shox2P70390 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Shox2P70390 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Shox2P70390 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Shox2P70390 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Shox2P70390 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Shox2P70390 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Shox2P70390 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Shox2P70390 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Shox2P70390 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Shox2P70390 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Shox2P70390 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Shox2P70390 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Shox2P70390 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Shox2P70390 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Shox2P70390 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Shox2P70390 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Shox2P70390 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Shox2P70390 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Shox2P70390 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Shox2P70390 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Shox2P70390 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Shox2P70390 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Shox2P70390 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms