Protein–RNA interactions for Protein: P70194

Clec4f, C-type lectin domain family 4 member F, mousemouse

Predictions only

Length 548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec4fP70194 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Clec4fP70194 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Clec4fP70194 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Clec4fP70194 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Clec4fP70194 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Clec4fP70194 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Clec4fP70194 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Clec4fP70194 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Clec4fP70194 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Clec4fP70194 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Clec4fP70194 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Clec4fP70194 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Clec4fP70194 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Clec4fP70194 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Clec4fP70194 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Clec4fP70194 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Clec4fP70194 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Clec4fP70194 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Clec4fP70194 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Clec4fP70194 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Clec4fP70194 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Clec4fP70194 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Clec4fP70194 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Clec4fP70194 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Clec4fP70194 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Clec4fP70194 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Clec4fP70194 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Clec4fP70194 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Clec4fP70194 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Clec4fP70194 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Clec4fP70194 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Clec4fP70194 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Clec4fP70194 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Clec4fP70194 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Clec4fP70194 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Clec4fP70194 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Clec4fP70194 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Clec4fP70194 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Clec4fP70194 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Clec4fP70194 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Clec4fP70194 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Clec4fP70194 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Clec4fP70194 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Clec4fP70194 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Clec4fP70194 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Clec4fP70194 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Clec4fP70194 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Clec4fP70194 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Clec4fP70194 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Clec4fP70194 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Clec4fP70194 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Clec4fP70194 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Clec4fP70194 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Clec4fP70194 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Clec4fP70194 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Clec4fP70194 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Clec4fP70194 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Clec4fP70194 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Clec4fP70194 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Clec4fP70194 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Clec4fP70194 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Clec4fP70194 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Clec4fP70194 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Clec4fP70194 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Clec4fP70194 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Clec4fP70194 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Clec4fP70194 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Clec4fP70194 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Clec4fP70194 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Clec4fP70194 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Clec4fP70194 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Clec4fP70194 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Clec4fP70194 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Clec4fP70194 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Clec4fP70194 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Clec4fP70194 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Clec4fP70194 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Clec4fP70194 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Clec4fP70194 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Clec4fP70194 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Clec4fP70194 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Clec4fP70194 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Clec4fP70194 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Clec4fP70194 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Clec4fP70194 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Clec4fP70194 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Clec4fP70194 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Clec4fP70194 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Clec4fP70194 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Clec4fP70194 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Clec4fP70194 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Clec4fP70194 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Clec4fP70194 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Clec4fP70194 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Clec4fP70194 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Clec4fP70194 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Clec4fP70194 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Clec4fP70194 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Clec4fP70194 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Clec4fP70194 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 205 ms