Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HBBP68871 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HBBP68871 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HBBP68871 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HBBP68871 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HBBP68871 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HBBP68871 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HBBP68871 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
HBBP68871 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HBBP68871 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HBBP68871 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HBBP68871 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HBBP68871 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HBBP68871 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HBBP68871 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HBBP68871 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HBBP68871 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HBBP68871 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HBBP68871 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HBBP68871 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HBBP68871 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HBBP68871 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HBBP68871 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HBBP68871 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HBBP68871 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HBBP68871 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
HBBP68871 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
HBBP68871 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
HBBP68871 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HBBP68871 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HBBP68871 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HBBP68871 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HBBP68871 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HBBP68871 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HBBP68871 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HBBP68871 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HBBP68871 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HBBP68871 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HBBP68871 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HBBP68871 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HBBP68871 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HBBP68871 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HBBP68871 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HBBP68871 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HBBP68871 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HBBP68871 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HBBP68871 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HBBP68871 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HBBP68871 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HBBP68871 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HBBP68871 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HBBP68871 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HBBP68871 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HBBP68871 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HBBP68871 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HBBP68871 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HBBP68871 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HBBP68871 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HBBP68871 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HBBP68871 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HBBP68871 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
HBBP68871 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
HBBP68871 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HBBP68871 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HBBP68871 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HBBP68871 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HBBP68871 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HBBP68871 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HBBP68871 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HBBP68871 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HBBP68871 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HBBP68871 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HBBP68871 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HBBP68871 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HBBP68871 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HBBP68871 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HBBP68871 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HBBP68871 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HBBP68871 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HBBP68871 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HBBP68871 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HBBP68871 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HBBP68871 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
HBBP68871 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HBBP68871 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HBBP68871 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HBBP68871 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HBBP68871 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HBBP68871 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HBBP68871 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HBBP68871 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HBBP68871 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HBBP68871 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HBBP68871 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HBBP68871 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HBBP68871 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
HBBP68871 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
HBBP68871 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HBBP68871 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HBBP68871 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.8 ms