Protein–RNA interactions for Protein: P68500

Cntn5, Contactin-5, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn5P68500 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cntn5P68500 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cntn5P68500 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cntn5P68500 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cntn5P68500 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cntn5P68500 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cntn5P68500 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cntn5P68500 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Cntn5P68500 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cntn5P68500 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cntn5P68500 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Cntn5P68500 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cntn5P68500 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cntn5P68500 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cntn5P68500 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cntn5P68500 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cntn5P68500 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cntn5P68500 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cntn5P68500 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cntn5P68500 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cntn5P68500 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cntn5P68500 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cntn5P68500 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Cntn5P68500 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cntn5P68500 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cntn5P68500 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Cntn5P68500 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Cntn5P68500 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cntn5P68500 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cntn5P68500 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cntn5P68500 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Cntn5P68500 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Cntn5P68500 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cntn5P68500 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cntn5P68500 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Cntn5P68500 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cntn5P68500 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cntn5P68500 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cntn5P68500 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cntn5P68500 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cntn5P68500 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cntn5P68500 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cntn5P68500 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cntn5P68500 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cntn5P68500 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Cntn5P68500 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cntn5P68500 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cntn5P68500 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cntn5P68500 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cntn5P68500 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cntn5P68500 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cntn5P68500 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cntn5P68500 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cntn5P68500 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cntn5P68500 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cntn5P68500 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cntn5P68500 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cntn5P68500 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cntn5P68500 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cntn5P68500 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cntn5P68500 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cntn5P68500 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cntn5P68500 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cntn5P68500 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cntn5P68500 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cntn5P68500 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cntn5P68500 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cntn5P68500 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cntn5P68500 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cntn5P68500 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cntn5P68500 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cntn5P68500 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cntn5P68500 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cntn5P68500 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Cntn5P68500 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cntn5P68500 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cntn5P68500 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cntn5P68500 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cntn5P68500 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Cntn5P68500 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Cntn5P68500 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cntn5P68500 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cntn5P68500 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cntn5P68500 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cntn5P68500 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cntn5P68500 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cntn5P68500 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cntn5P68500 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cntn5P68500 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cntn5P68500 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cntn5P68500 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cntn5P68500 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cntn5P68500 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cntn5P68500 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Cntn5P68500 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Cntn5P68500 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cntn5P68500 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cntn5P68500 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cntn5P68500 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cntn5P68500 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.6 ms