Protein–RNA interactions for Protein: P68372

Tubb4b, Tubulin beta-4B chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb4bP68372 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tubb4bP68372 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tubb4bP68372 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tubb4bP68372 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tubb4bP68372 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tubb4bP68372 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tubb4bP68372 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tubb4bP68372 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tubb4bP68372 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tubb4bP68372 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tubb4bP68372 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tubb4bP68372 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Tubb4bP68372 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tubb4bP68372 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tubb4bP68372 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tubb4bP68372 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tubb4bP68372 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tubb4bP68372 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tubb4bP68372 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tubb4bP68372 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tubb4bP68372 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tubb4bP68372 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tubb4bP68372 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tubb4bP68372 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tubb4bP68372 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tubb4bP68372 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tubb4bP68372 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Tubb4bP68372 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tubb4bP68372 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tubb4bP68372 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tubb4bP68372 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tubb4bP68372 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tubb4bP68372 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tubb4bP68372 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tubb4bP68372 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tubb4bP68372 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tubb4bP68372 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tubb4bP68372 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tubb4bP68372 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Tubb4bP68372 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tubb4bP68372 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tubb4bP68372 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tubb4bP68372 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tubb4bP68372 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tubb4bP68372 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tubb4bP68372 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tubb4bP68372 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Tubb4bP68372 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Tubb4bP68372 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Tubb4bP68372 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tubb4bP68372 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tubb4bP68372 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tubb4bP68372 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tubb4bP68372 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tubb4bP68372 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tubb4bP68372 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Tubb4bP68372 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tubb4bP68372 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tubb4bP68372 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tubb4bP68372 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tubb4bP68372 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tubb4bP68372 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tubb4bP68372 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tubb4bP68372 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Tubb4bP68372 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Tubb4bP68372 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Tubb4bP68372 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Tubb4bP68372 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tubb4bP68372 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tubb4bP68372 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Tubb4bP68372 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tubb4bP68372 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tubb4bP68372 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tubb4bP68372 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tubb4bP68372 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tubb4bP68372 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tubb4bP68372 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tubb4bP68372 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tubb4bP68372 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tubb4bP68372 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tubb4bP68372 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tubb4bP68372 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tubb4bP68372 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tubb4bP68372 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tubb4bP68372 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tubb4bP68372 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tubb4bP68372 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tubb4bP68372 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tubb4bP68372 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tubb4bP68372 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tubb4bP68372 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tubb4bP68372 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tubb4bP68372 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tubb4bP68372 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tubb4bP68372 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tubb4bP68372 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tubb4bP68372 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tubb4bP68372 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tubb4bP68372 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tubb4bP68372 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms