Protein–RNA interactions for Protein: P68371

TUBB4B, Tubulin beta-4B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4BP68371 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TUBB4BP68371 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TUBB4BP68371 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TUBB4BP68371 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TUBB4BP68371 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TUBB4BP68371 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TUBB4BP68371 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TUBB4BP68371 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TUBB4BP68371 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TUBB4BP68371 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TUBB4BP68371 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
TUBB4BP68371 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TUBB4BP68371 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TUBB4BP68371 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TUBB4BP68371 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TUBB4BP68371 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
TUBB4BP68371 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TUBB4BP68371 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TUBB4BP68371 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TUBB4BP68371 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TUBB4BP68371 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TUBB4BP68371 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
TUBB4BP68371 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TUBB4BP68371 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TUBB4BP68371 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TUBB4BP68371 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TUBB4BP68371 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TUBB4BP68371 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TUBB4BP68371 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TUBB4BP68371 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TUBB4BP68371 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
TUBB4BP68371 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TUBB4BP68371 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TUBB4BP68371 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TUBB4BP68371 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TUBB4BP68371 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TUBB4BP68371 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TUBB4BP68371 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TUBB4BP68371 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TUBB4BP68371 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TUBB4BP68371 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TUBB4BP68371 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TUBB4BP68371 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TUBB4BP68371 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TUBB4BP68371 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TUBB4BP68371 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TUBB4BP68371 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TUBB4BP68371 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TUBB4BP68371 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TUBB4BP68371 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
TUBB4BP68371 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TUBB4BP68371 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TUBB4BP68371 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TUBB4BP68371 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TUBB4BP68371 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TUBB4BP68371 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TUBB4BP68371 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TUBB4BP68371 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TUBB4BP68371 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TUBB4BP68371 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TUBB4BP68371 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TUBB4BP68371 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TUBB4BP68371 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TUBB4BP68371 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TUBB4BP68371 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TUBB4BP68371 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TUBB4BP68371 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TUBB4BP68371 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TUBB4BP68371 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TUBB4BP68371 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TUBB4BP68371 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TUBB4BP68371 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TUBB4BP68371 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TUBB4BP68371 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TUBB4BP68371 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TUBB4BP68371 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TUBB4BP68371 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TUBB4BP68371 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TUBB4BP68371 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TUBB4BP68371 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TUBB4BP68371 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
TUBB4BP68371 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
TUBB4BP68371 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
TUBB4BP68371 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TUBB4BP68371 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TUBB4BP68371 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TUBB4BP68371 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TUBB4BP68371 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TUBB4BP68371 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TUBB4BP68371 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TUBB4BP68371 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TUBB4BP68371 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TUBB4BP68371 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TUBB4BP68371 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TUBB4BP68371 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TUBB4BP68371 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TUBB4BP68371 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TUBB4BP68371 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TUBB4BP68371 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TUBB4BP68371 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 552.7 ms