Protein–RNA interactions for Protein: P68133

ACTA1, Actin, alpha skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA1P68133 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACTA1P68133 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACTA1P68133 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACTA1P68133 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACTA1P68133 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACTA1P68133 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACTA1P68133 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACTA1P68133 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACTA1P68133 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACTA1P68133 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACTA1P68133 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACTA1P68133 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACTA1P68133 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACTA1P68133 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACTA1P68133 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACTA1P68133 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACTA1P68133 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACTA1P68133 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACTA1P68133 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACTA1P68133 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACTA1P68133 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACTA1P68133 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACTA1P68133 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACTA1P68133 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ACTA1P68133 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACTA1P68133 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ACTA1P68133 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACTA1P68133 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACTA1P68133 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACTA1P68133 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACTA1P68133 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACTA1P68133 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACTA1P68133 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACTA1P68133 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
ACTA1P68133 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ACTA1P68133 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACTA1P68133 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACTA1P68133 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACTA1P68133 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACTA1P68133 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACTA1P68133 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACTA1P68133 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACTA1P68133 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACTA1P68133 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACTA1P68133 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACTA1P68133 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ACTA1P68133 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ACTA1P68133 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ACTA1P68133 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ACTA1P68133 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ACTA1P68133 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ACTA1P68133 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACTA1P68133 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACTA1P68133 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACTA1P68133 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACTA1P68133 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACTA1P68133 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACTA1P68133 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACTA1P68133 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ACTA1P68133 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACTA1P68133 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACTA1P68133 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACTA1P68133 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACTA1P68133 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACTA1P68133 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACTA1P68133 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACTA1P68133 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACTA1P68133 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACTA1P68133 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ACTA1P68133 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACTA1P68133 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACTA1P68133 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACTA1P68133 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACTA1P68133 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACTA1P68133 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ACTA1P68133 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACTA1P68133 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACTA1P68133 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACTA1P68133 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACTA1P68133 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACTA1P68133 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACTA1P68133 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACTA1P68133 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACTA1P68133 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACTA1P68133 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ACTA1P68133 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ACTA1P68133 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ACTA1P68133 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACTA1P68133 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACTA1P68133 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACTA1P68133 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACTA1P68133 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACTA1P68133 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACTA1P68133 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACTA1P68133 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ACTA1P68133 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACTA1P68133 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACTA1P68133 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACTA1P68133 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACTA1P68133 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms