Protein–RNA interactions for Protein: P67936

TPM4, Tropomyosin alpha-4 chain, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM4P67936 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TPM4P67936 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TPM4P67936 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TPM4P67936 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TPM4P67936 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TPM4P67936 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TPM4P67936 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TPM4P67936 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TPM4P67936 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TPM4P67936 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TPM4P67936 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TPM4P67936 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TPM4P67936 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TPM4P67936 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
TPM4P67936 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TPM4P67936 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
TPM4P67936 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.11
TPM4P67936 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
TPM4P67936 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TPM4P67936 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TPM4P67936 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TPM4P67936 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TPM4P67936 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TPM4P67936 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TPM4P67936 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TPM4P67936 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TPM4P67936 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TPM4P67936 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TPM4P67936 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TPM4P67936 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TPM4P67936 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TPM4P67936 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TPM4P67936 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TPM4P67936 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TPM4P67936 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TPM4P67936 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TPM4P67936 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TPM4P67936 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TPM4P67936 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TPM4P67936 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
TPM4P67936 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
TPM4P67936 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
TPM4P67936 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TPM4P67936 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TPM4P67936 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TPM4P67936 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TPM4P67936 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TPM4P67936 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TPM4P67936 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TPM4P67936 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TPM4P67936 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
TPM4P67936 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TPM4P67936 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TPM4P67936 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TPM4P67936 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TPM4P67936 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TPM4P67936 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TPM4P67936 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TPM4P67936 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TPM4P67936 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TPM4P67936 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TPM4P67936 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TPM4P67936 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TPM4P67936 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TPM4P67936 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TPM4P67936 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TPM4P67936 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TPM4P67936 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TPM4P67936 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TPM4P67936 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TPM4P67936 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TPM4P67936 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TPM4P67936 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TPM4P67936 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TPM4P67936 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TPM4P67936 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TPM4P67936 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TPM4P67936 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TPM4P67936 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TPM4P67936 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TPM4P67936 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TPM4P67936 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TPM4P67936 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TPM4P67936 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TPM4P67936 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TPM4P67936 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TPM4P67936 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TPM4P67936 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TPM4P67936 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TPM4P67936 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TPM4P67936 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TPM4P67936 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
TPM4P67936 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TPM4P67936 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TPM4P67936 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
TPM4P67936 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TPM4P67936 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
TPM4P67936 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
TPM4P67936 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
TPM4P67936 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.1 ms