Protein–RNA interactions for Protein: P63158

Hmgb1, High mobility group protein B1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgb1P63158 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Hmgb1P63158 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Hmgb1P63158 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Hmgb1P63158 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Hmgb1P63158 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Hmgb1P63158 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Hmgb1P63158 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Hmgb1P63158 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Hmgb1P63158 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Hmgb1P63158 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Hmgb1P63158 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Hmgb1P63158 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Hmgb1P63158 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Hmgb1P63158 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Hmgb1P63158 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Hmgb1P63158 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Hmgb1P63158 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Hmgb1P63158 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Hmgb1P63158 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Hmgb1P63158 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Hmgb1P63158 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Hmgb1P63158 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Hmgb1P63158 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Hmgb1P63158 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Hmgb1P63158 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Hmgb1P63158 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Hmgb1P63158 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Hmgb1P63158 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Hmgb1P63158 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Hmgb1P63158 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Hmgb1P63158 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Hmgb1P63158 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Hmgb1P63158 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Hmgb1P63158 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Hmgb1P63158 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Hmgb1P63158 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Hmgb1P63158 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Hmgb1P63158 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Hmgb1P63158 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Hmgb1P63158 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Hmgb1P63158 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Hmgb1P63158 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Hmgb1P63158 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Hmgb1P63158 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Hmgb1P63158 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Hmgb1P63158 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Hmgb1P63158 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Hmgb1P63158 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Hmgb1P63158 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Hmgb1P63158 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Hmgb1P63158 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Hmgb1P63158 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Hmgb1P63158 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Hmgb1P63158 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Hmgb1P63158 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Hmgb1P63158 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Hmgb1P63158 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Hmgb1P63158 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Hmgb1P63158 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Hmgb1P63158 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Hmgb1P63158 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Hmgb1P63158 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Hmgb1P63158 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Hmgb1P63158 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Hmgb1P63158 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Hmgb1P63158 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Hmgb1P63158 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Hmgb1P63158 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Hmgb1P63158 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Hmgb1P63158 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Hmgb1P63158 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Hmgb1P63158 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Hmgb1P63158 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Hmgb1P63158 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Hmgb1P63158 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Hmgb1P63158 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Hmgb1P63158 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Hmgb1P63158 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Hmgb1P63158 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Hmgb1P63158 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Hmgb1P63158 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Hmgb1P63158 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Hmgb1P63158 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Hmgb1P63158 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Hmgb1P63158 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Hmgb1P63158 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Hmgb1P63158 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Hmgb1P63158 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Hmgb1P63158 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Hmgb1P63158 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Hmgb1P63158 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Hmgb1P63158 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Hmgb1P63158 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Hmgb1P63158 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Hmgb1P63158 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Hmgb1P63158 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Hmgb1P63158 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Hmgb1P63158 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Hmgb1P63158 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Hmgb1P63158 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms