Protein–RNA interactions for Protein: P62995

TRA2B, Transformer-2 protein homolog beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRA2BP62995 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRA2BP62995 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRA2BP62995 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRA2BP62995 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRA2BP62995 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRA2BP62995 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TRA2BP62995 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRA2BP62995 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRA2BP62995 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRA2BP62995 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRA2BP62995 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRA2BP62995 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRA2BP62995 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRA2BP62995 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRA2BP62995 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRA2BP62995 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRA2BP62995 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRA2BP62995 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
TRA2BP62995 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRA2BP62995 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TRA2BP62995 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRA2BP62995 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRA2BP62995 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
TRA2BP62995 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
TRA2BP62995 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRA2BP62995 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRA2BP62995 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRA2BP62995 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRA2BP62995 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRA2BP62995 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRA2BP62995 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRA2BP62995 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRA2BP62995 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRA2BP62995 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRA2BP62995 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRA2BP62995 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRA2BP62995 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRA2BP62995 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TRA2BP62995 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
TRA2BP62995 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRA2BP62995 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRA2BP62995 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRA2BP62995 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRA2BP62995 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRA2BP62995 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRA2BP62995 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRA2BP62995 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRA2BP62995 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRA2BP62995 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
TRA2BP62995 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRA2BP62995 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRA2BP62995 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRA2BP62995 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRA2BP62995 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRA2BP62995 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRA2BP62995 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRA2BP62995 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRA2BP62995 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRA2BP62995 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRA2BP62995 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRA2BP62995 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRA2BP62995 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRA2BP62995 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRA2BP62995 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRA2BP62995 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRA2BP62995 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRA2BP62995 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRA2BP62995 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRA2BP62995 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRA2BP62995 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRA2BP62995 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRA2BP62995 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRA2BP62995 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRA2BP62995 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRA2BP62995 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRA2BP62995 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRA2BP62995 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRA2BP62995 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRA2BP62995 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRA2BP62995 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRA2BP62995 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRA2BP62995 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRA2BP62995 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRA2BP62995 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRA2BP62995 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRA2BP62995 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRA2BP62995 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRA2BP62995 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRA2BP62995 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRA2BP62995 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRA2BP62995 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRA2BP62995 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRA2BP62995 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRA2BP62995 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRA2BP62995 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRA2BP62995 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRA2BP62995 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRA2BP62995 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRA2BP62995 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRA2BP62995 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.6 ms