Protein–RNA interactions for Protein: P62918

Rpl8, 60S ribosomal protein L8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl8P62918 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rpl8P62918 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Rpl8P62918 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rpl8P62918 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rpl8P62918 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rpl8P62918 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rpl8P62918 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rpl8P62918 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rpl8P62918 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rpl8P62918 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rpl8P62918 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rpl8P62918 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rpl8P62918 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rpl8P62918 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rpl8P62918 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rpl8P62918 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rpl8P62918 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rpl8P62918 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rpl8P62918 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rpl8P62918 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rpl8P62918 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rpl8P62918 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rpl8P62918 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rpl8P62918 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rpl8P62918 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rpl8P62918 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rpl8P62918 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rpl8P62918 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rpl8P62918 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rpl8P62918 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rpl8P62918 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rpl8P62918 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rpl8P62918 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rpl8P62918 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rpl8P62918 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rpl8P62918 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Rpl8P62918 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rpl8P62918 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rpl8P62918 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rpl8P62918 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rpl8P62918 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rpl8P62918 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rpl8P62918 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rpl8P62918 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rpl8P62918 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rpl8P62918 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rpl8P62918 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rpl8P62918 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rpl8P62918 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rpl8P62918 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rpl8P62918 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rpl8P62918 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rpl8P62918 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rpl8P62918 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rpl8P62918 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rpl8P62918 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rpl8P62918 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rpl8P62918 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rpl8P62918 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rpl8P62918 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rpl8P62918 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rpl8P62918 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rpl8P62918 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rpl8P62918 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rpl8P62918 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rpl8P62918 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rpl8P62918 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rpl8P62918 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rpl8P62918 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rpl8P62918 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rpl8P62918 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rpl8P62918 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rpl8P62918 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rpl8P62918 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rpl8P62918 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rpl8P62918 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rpl8P62918 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rpl8P62918 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rpl8P62918 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rpl8P62918 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpl8P62918 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpl8P62918 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpl8P62918 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpl8P62918 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rpl8P62918 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rpl8P62918 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rpl8P62918 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rpl8P62918 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rpl8P62918 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rpl8P62918 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rpl8P62918 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Rpl8P62918 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rpl8P62918 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rpl8P62918 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rpl8P62918 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rpl8P62918 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpl8P62918 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpl8P62918 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpl8P62918 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpl8P62918 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.1 ms