Protein–RNA interactions for Protein: P62877

RBX1, E3 ubiquitin-protein ligase RBX1, humanhuman

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBX1P62877 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RBX1P62877 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RBX1P62877 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RBX1P62877 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RBX1P62877 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RBX1P62877 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RBX1P62877 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RBX1P62877 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RBX1P62877 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RBX1P62877 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RBX1P62877 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RBX1P62877 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RBX1P62877 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RBX1P62877 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RBX1P62877 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RBX1P62877 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RBX1P62877 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RBX1P62877 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RBX1P62877 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RBX1P62877 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RBX1P62877 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RBX1P62877 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RBX1P62877 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RBX1P62877 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RBX1P62877 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RBX1P62877 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
RBX1P62877 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
RBX1P62877 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RBX1P62877 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RBX1P62877 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RBX1P62877 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RBX1P62877 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RBX1P62877 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RBX1P62877 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RBX1P62877 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RBX1P62877 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RBX1P62877 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RBX1P62877 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RBX1P62877 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RBX1P62877 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RBX1P62877 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RBX1P62877 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RBX1P62877 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RBX1P62877 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
RBX1P62877 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
RBX1P62877 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RBX1P62877 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RBX1P62877 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RBX1P62877 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RBX1P62877 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RBX1P62877 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RBX1P62877 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RBX1P62877 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RBX1P62877 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RBX1P62877 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RBX1P62877 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RBX1P62877 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RBX1P62877 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RBX1P62877 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RBX1P62877 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RBX1P62877 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RBX1P62877 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RBX1P62877 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RBX1P62877 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RBX1P62877 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RBX1P62877 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RBX1P62877 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RBX1P62877 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RBX1P62877 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RBX1P62877 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RBX1P62877 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RBX1P62877 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RBX1P62877 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RBX1P62877 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RBX1P62877 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RBX1P62877 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RBX1P62877 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RBX1P62877 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RBX1P62877 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RBX1P62877 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RBX1P62877 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RBX1P62877 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RBX1P62877 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RBX1P62877 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RBX1P62877 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RBX1P62877 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RBX1P62877 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RBX1P62877 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RBX1P62877 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RBX1P62877 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RBX1P62877 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RBX1P62877 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RBX1P62877 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RBX1P62877 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RBX1P62877 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RBX1P62877 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RBX1P62877 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RBX1P62877 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RBX1P62877 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RBX1P62877 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms