Protein–RNA interactions for Protein: P62330

ARF6, ADP-ribosylation factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF6P62330 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ARF6P62330 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ARF6P62330 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ARF6P62330 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ARF6P62330 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ARF6P62330 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
ARF6P62330 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ARF6P62330 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ARF6P62330 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ARF6P62330 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ARF6P62330 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ARF6P62330 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ARF6P62330 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ARF6P62330 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ARF6P62330 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ARF6P62330 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ARF6P62330 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ARF6P62330 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ARF6P62330 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ARF6P62330 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ARF6P62330 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ARF6P62330 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ARF6P62330 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ARF6P62330 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ARF6P62330 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ARF6P62330 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ARF6P62330 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ARF6P62330 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ARF6P62330 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ARF6P62330 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ARF6P62330 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ARF6P62330 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ARF6P62330 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ARF6P62330 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
ARF6P62330 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ARF6P62330 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ARF6P62330 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ARF6P62330 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ARF6P62330 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ARF6P62330 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ARF6P62330 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ARF6P62330 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ARF6P62330 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ARF6P62330 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ARF6P62330 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ARF6P62330 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ARF6P62330 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ARF6P62330 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ARF6P62330 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ARF6P62330 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ARF6P62330 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ARF6P62330 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ARF6P62330 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ARF6P62330 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ARF6P62330 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ARF6P62330 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ARF6P62330 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ARF6P62330 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ARF6P62330 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ARF6P62330 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ARF6P62330 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ARF6P62330 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ARF6P62330 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ARF6P62330 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ARF6P62330 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ARF6P62330 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ARF6P62330 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ARF6P62330 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ARF6P62330 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ARF6P62330 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ARF6P62330 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ARF6P62330 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ARF6P62330 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ARF6P62330 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ARF6P62330 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ARF6P62330 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ARF6P62330 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ARF6P62330 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ARF6P62330 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ARF6P62330 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ARF6P62330 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ARF6P62330 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ARF6P62330 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ARF6P62330 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ARF6P62330 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ARF6P62330 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ARF6P62330 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ARF6P62330 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ARF6P62330 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ARF6P62330 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ARF6P62330 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ARF6P62330 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ARF6P62330 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ARF6P62330 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ARF6P62330 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ARF6P62330 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ARF6P62330 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ARF6P62330 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ARF6P62330 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ARF6P62330 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms