Protein–RNA interactions for Protein: P62307

Snrpf, Small nuclear ribonucleoprotein F, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpfP62307 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SnrpfP62307 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SnrpfP62307 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SnrpfP62307 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SnrpfP62307 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SnrpfP62307 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SnrpfP62307 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SnrpfP62307 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SnrpfP62307 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SnrpfP62307 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SnrpfP62307 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SnrpfP62307 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SnrpfP62307 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SnrpfP62307 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SnrpfP62307 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SnrpfP62307 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SnrpfP62307 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SnrpfP62307 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SnrpfP62307 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SnrpfP62307 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SnrpfP62307 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SnrpfP62307 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SnrpfP62307 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SnrpfP62307 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SnrpfP62307 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SnrpfP62307 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SnrpfP62307 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SnrpfP62307 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SnrpfP62307 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SnrpfP62307 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SnrpfP62307 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SnrpfP62307 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SnrpfP62307 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SnrpfP62307 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SnrpfP62307 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SnrpfP62307 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SnrpfP62307 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SnrpfP62307 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SnrpfP62307 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SnrpfP62307 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SnrpfP62307 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SnrpfP62307 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SnrpfP62307 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SnrpfP62307 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SnrpfP62307 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SnrpfP62307 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SnrpfP62307 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SnrpfP62307 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SnrpfP62307 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SnrpfP62307 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SnrpfP62307 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SnrpfP62307 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SnrpfP62307 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SnrpfP62307 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SnrpfP62307 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SnrpfP62307 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SnrpfP62307 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SnrpfP62307 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SnrpfP62307 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SnrpfP62307 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SnrpfP62307 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SnrpfP62307 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SnrpfP62307 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SnrpfP62307 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SnrpfP62307 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SnrpfP62307 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SnrpfP62307 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SnrpfP62307 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SnrpfP62307 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SnrpfP62307 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SnrpfP62307 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SnrpfP62307 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SnrpfP62307 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SnrpfP62307 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SnrpfP62307 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SnrpfP62307 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SnrpfP62307 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SnrpfP62307 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SnrpfP62307 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SnrpfP62307 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SnrpfP62307 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SnrpfP62307 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SnrpfP62307 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SnrpfP62307 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SnrpfP62307 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SnrpfP62307 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SnrpfP62307 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SnrpfP62307 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SnrpfP62307 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SnrpfP62307 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SnrpfP62307 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
SnrpfP62307 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SnrpfP62307 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SnrpfP62307 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SnrpfP62307 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SnrpfP62307 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SnrpfP62307 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SnrpfP62307 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SnrpfP62307 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SnrpfP62307 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 133.8 ms