Protein–RNA interactions for Protein: P62137

Ppp1ca, Serine/threonine-protein phosphatase PP1-alpha catalytic subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp1caP62137 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Ppp1caP62137 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Ppp1caP62137 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Ppp1caP62137 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ppp1caP62137 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ppp1caP62137 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ppp1caP62137 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Ppp1caP62137 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ppp1caP62137 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ppp1caP62137 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ppp1caP62137 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ppp1caP62137 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ppp1caP62137 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ppp1caP62137 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Ppp1caP62137 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ppp1caP62137 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ppp1caP62137 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ppp1caP62137 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ppp1caP62137 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ppp1caP62137 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ppp1caP62137 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ppp1caP62137 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ppp1caP62137 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ppp1caP62137 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Ppp1caP62137 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ppp1caP62137 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ppp1caP62137 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ppp1caP62137 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Ppp1caP62137 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ppp1caP62137 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ppp1caP62137 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ppp1caP62137 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ppp1caP62137 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ppp1caP62137 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ppp1caP62137 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ppp1caP62137 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ppp1caP62137 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ppp1caP62137 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ppp1caP62137 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ppp1caP62137 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ppp1caP62137 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ppp1caP62137 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ppp1caP62137 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ppp1caP62137 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ppp1caP62137 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ppp1caP62137 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ppp1caP62137 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ppp1caP62137 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ppp1caP62137 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ppp1caP62137 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ppp1caP62137 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ppp1caP62137 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ppp1caP62137 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ppp1caP62137 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ppp1caP62137 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ppp1caP62137 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ppp1caP62137 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppp1caP62137 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Ppp1caP62137 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ppp1caP62137 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ppp1caP62137 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ppp1caP62137 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ppp1caP62137 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ppp1caP62137 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ppp1caP62137 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ppp1caP62137 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ppp1caP62137 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ppp1caP62137 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ppp1caP62137 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ppp1caP62137 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ppp1caP62137 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ppp1caP62137 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ppp1caP62137 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ppp1caP62137 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ppp1caP62137 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ppp1caP62137 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ppp1caP62137 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ppp1caP62137 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ppp1caP62137 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ppp1caP62137 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ppp1caP62137 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ppp1caP62137 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ppp1caP62137 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ppp1caP62137 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ppp1caP62137 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ppp1caP62137 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ppp1caP62137 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ppp1caP62137 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ppp1caP62137 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ppp1caP62137 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ppp1caP62137 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ppp1caP62137 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Ppp1caP62137 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ppp1caP62137 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Ppp1caP62137 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ppp1caP62137 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ppp1caP62137 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ppp1caP62137 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ppp1caP62137 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ppp1caP62137 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms