Protein–RNA interactions for Protein: P62046

Lrch1, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrch1P62046 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Lrch1P62046 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Lrch1P62046 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Lrch1P62046 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Lrch1P62046 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Lrch1P62046 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Lrch1P62046 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Lrch1P62046 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Lrch1P62046 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Lrch1P62046 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Lrch1P62046 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Lrch1P62046 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Lrch1P62046 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Lrch1P62046 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Lrch1P62046 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Lrch1P62046 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Lrch1P62046 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Lrch1P62046 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Lrch1P62046 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Lrch1P62046 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Lrch1P62046 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Lrch1P62046 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Lrch1P62046 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Lrch1P62046 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Lrch1P62046 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Lrch1P62046 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Lrch1P62046 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Lrch1P62046 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Lrch1P62046 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Lrch1P62046 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Lrch1P62046 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Lrch1P62046 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Lrch1P62046 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Lrch1P62046 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Lrch1P62046 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Lrch1P62046 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Lrch1P62046 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Lrch1P62046 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Lrch1P62046 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Lrch1P62046 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Lrch1P62046 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Lrch1P62046 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Lrch1P62046 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Lrch1P62046 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Lrch1P62046 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Lrch1P62046 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Lrch1P62046 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Lrch1P62046 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Lrch1P62046 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Lrch1P62046 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Lrch1P62046 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Lrch1P62046 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Lrch1P62046 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Lrch1P62046 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Lrch1P62046 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Lrch1P62046 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Lrch1P62046 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Lrch1P62046 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Lrch1P62046 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Lrch1P62046 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Lrch1P62046 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Lrch1P62046 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Lrch1P62046 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Lrch1P62046 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Lrch1P62046 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Lrch1P62046 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Lrch1P62046 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Lrch1P62046 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
Lrch1P62046 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Lrch1P62046 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Lrch1P62046 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Lrch1P62046 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Lrch1P62046 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Lrch1P62046 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Lrch1P62046 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Lrch1P62046 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Lrch1P62046 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Lrch1P62046 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Lrch1P62046 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Lrch1P62046 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Lrch1P62046 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Lrch1P62046 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Lrch1P62046 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Lrch1P62046 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Lrch1P62046 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Lrch1P62046 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Lrch1P62046 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Lrch1P62046 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Lrch1P62046 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Lrch1P62046 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Lrch1P62046 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Lrch1P62046 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Lrch1P62046 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Lrch1P62046 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Lrch1P62046 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Lrch1P62046 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Lrch1P62046 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Lrch1P62046 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Lrch1P62046 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Lrch1P62046 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms