Protein–RNA interactions for Protein: P61924

Copz1, Coatomer subunit zeta-1, mousemouse

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copz1P61924 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Copz1P61924 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Copz1P61924 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Copz1P61924 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Copz1P61924 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Copz1P61924 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Copz1P61924 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Copz1P61924 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Copz1P61924 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Copz1P61924 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Copz1P61924 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Copz1P61924 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Copz1P61924 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Copz1P61924 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Copz1P61924 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Copz1P61924 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Copz1P61924 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Copz1P61924 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Copz1P61924 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Copz1P61924 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Copz1P61924 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Copz1P61924 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Copz1P61924 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Copz1P61924 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Copz1P61924 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Copz1P61924 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Copz1P61924 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Copz1P61924 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Copz1P61924 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Copz1P61924 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Copz1P61924 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Copz1P61924 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Copz1P61924 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Copz1P61924 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Copz1P61924 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Copz1P61924 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Copz1P61924 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Copz1P61924 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Copz1P61924 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Copz1P61924 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Copz1P61924 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Copz1P61924 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Copz1P61924 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Copz1P61924 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Copz1P61924 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Copz1P61924 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Copz1P61924 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Copz1P61924 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Copz1P61924 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Copz1P61924 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Copz1P61924 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Copz1P61924 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Copz1P61924 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Copz1P61924 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Copz1P61924 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Copz1P61924 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Copz1P61924 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Copz1P61924 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Copz1P61924 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Copz1P61924 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Copz1P61924 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Copz1P61924 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Copz1P61924 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Copz1P61924 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Copz1P61924 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Copz1P61924 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Copz1P61924 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Copz1P61924 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Copz1P61924 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Copz1P61924 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Copz1P61924 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Copz1P61924 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Copz1P61924 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Copz1P61924 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Copz1P61924 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Copz1P61924 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Copz1P61924 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Copz1P61924 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Copz1P61924 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Copz1P61924 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Copz1P61924 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Copz1P61924 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Copz1P61924 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Copz1P61924 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Copz1P61924 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Copz1P61924 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Copz1P61924 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Copz1P61924 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Copz1P61924 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Copz1P61924 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Copz1P61924 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Copz1P61924 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Copz1P61924 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Copz1P61924 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Copz1P61924 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Copz1P61924 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Copz1P61924 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Copz1P61924 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Copz1P61924 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Copz1P61924 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms