Protein–RNA interactions for Protein: P61807

Snn, Stannin, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnnP61807 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SnnP61807 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SnnP61807 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SnnP61807 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SnnP61807 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SnnP61807 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SnnP61807 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SnnP61807 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SnnP61807 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SnnP61807 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SnnP61807 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SnnP61807 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SnnP61807 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SnnP61807 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SnnP61807 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SnnP61807 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SnnP61807 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SnnP61807 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SnnP61807 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SnnP61807 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SnnP61807 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SnnP61807 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SnnP61807 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SnnP61807 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SnnP61807 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SnnP61807 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SnnP61807 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SnnP61807 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SnnP61807 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SnnP61807 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SnnP61807 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SnnP61807 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SnnP61807 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SnnP61807 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SnnP61807 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SnnP61807 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SnnP61807 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SnnP61807 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SnnP61807 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SnnP61807 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SnnP61807 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SnnP61807 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SnnP61807 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SnnP61807 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SnnP61807 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SnnP61807 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SnnP61807 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SnnP61807 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SnnP61807 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SnnP61807 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SnnP61807 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SnnP61807 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SnnP61807 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SnnP61807 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SnnP61807 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SnnP61807 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SnnP61807 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SnnP61807 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SnnP61807 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SnnP61807 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SnnP61807 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SnnP61807 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SnnP61807 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SnnP61807 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SnnP61807 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SnnP61807 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SnnP61807 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SnnP61807 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SnnP61807 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SnnP61807 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SnnP61807 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SnnP61807 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SnnP61807 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SnnP61807 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SnnP61807 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SnnP61807 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SnnP61807 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SnnP61807 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SnnP61807 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SnnP61807 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SnnP61807 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SnnP61807 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SnnP61807 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SnnP61807 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SnnP61807 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SnnP61807 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SnnP61807 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SnnP61807 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SnnP61807 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SnnP61807 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SnnP61807 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SnnP61807 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SnnP61807 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SnnP61807 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SnnP61807 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SnnP61807 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SnnP61807 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SnnP61807 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SnnP61807 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SnnP61807 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms