Protein–RNA interactions for Protein: P61289

PSME3, Proteasome activator complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME3P61289 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PSME3P61289 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PSME3P61289 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PSME3P61289 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PSME3P61289 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PSME3P61289 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PSME3P61289 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PSME3P61289 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PSME3P61289 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PSME3P61289 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PSME3P61289 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PSME3P61289 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PSME3P61289 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PSME3P61289 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PSME3P61289 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PSME3P61289 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PSME3P61289 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PSME3P61289 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PSME3P61289 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PSME3P61289 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PSME3P61289 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PSME3P61289 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSME3P61289 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSME3P61289 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSME3P61289 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSME3P61289 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSME3P61289 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PSME3P61289 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSME3P61289 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PSME3P61289 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PSME3P61289 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PSME3P61289 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PSME3P61289 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PSME3P61289 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PSME3P61289 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PSME3P61289 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PSME3P61289 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PSME3P61289 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PSME3P61289 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PSME3P61289 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PSME3P61289 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PSME3P61289 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PSME3P61289 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PSME3P61289 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PSME3P61289 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PSME3P61289 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PSME3P61289 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PSME3P61289 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PSME3P61289 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PSME3P61289 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PSME3P61289 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PSME3P61289 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PSME3P61289 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PSME3P61289 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PSME3P61289 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PSME3P61289 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PSME3P61289 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PSME3P61289 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PSME3P61289 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PSME3P61289 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PSME3P61289 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PSME3P61289 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PSME3P61289 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PSME3P61289 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PSME3P61289 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PSME3P61289 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PSME3P61289 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PSME3P61289 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PSME3P61289 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PSME3P61289 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PSME3P61289 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PSME3P61289 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PSME3P61289 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PSME3P61289 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PSME3P61289 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PSME3P61289 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PSME3P61289 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PSME3P61289 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PSME3P61289 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PSME3P61289 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PSME3P61289 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PSME3P61289 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PSME3P61289 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PSME3P61289 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PSME3P61289 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PSME3P61289 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PSME3P61289 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PSME3P61289 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PSME3P61289 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PSME3P61289 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PSME3P61289 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PSME3P61289 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PSME3P61289 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PSME3P61289 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PSME3P61289 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PSME3P61289 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
PSME3P61289 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PSME3P61289 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PSME3P61289 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PSME3P61289 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms