Protein–RNA interactions for Protein: P61218

POLR2F, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2FP61218 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
POLR2FP61218 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
POLR2FP61218 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
POLR2FP61218 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
POLR2FP61218 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
POLR2FP61218 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
POLR2FP61218 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
POLR2FP61218 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
POLR2FP61218 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
POLR2FP61218 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
POLR2FP61218 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
POLR2FP61218 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
POLR2FP61218 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
POLR2FP61218 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
POLR2FP61218 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
POLR2FP61218 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
POLR2FP61218 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
POLR2FP61218 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
POLR2FP61218 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
POLR2FP61218 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
POLR2FP61218 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
POLR2FP61218 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
POLR2FP61218 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
POLR2FP61218 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
POLR2FP61218 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
POLR2FP61218 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
POLR2FP61218 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
POLR2FP61218 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
POLR2FP61218 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
POLR2FP61218 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
POLR2FP61218 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
POLR2FP61218 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
POLR2FP61218 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
POLR2FP61218 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
POLR2FP61218 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
POLR2FP61218 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
POLR2FP61218 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
POLR2FP61218 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
POLR2FP61218 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
POLR2FP61218 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
POLR2FP61218 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
POLR2FP61218 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
POLR2FP61218 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
POLR2FP61218 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
POLR2FP61218 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
POLR2FP61218 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
POLR2FP61218 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
POLR2FP61218 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
POLR2FP61218 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
POLR2FP61218 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
POLR2FP61218 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
POLR2FP61218 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
POLR2FP61218 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
POLR2FP61218 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
POLR2FP61218 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
POLR2FP61218 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
POLR2FP61218 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
POLR2FP61218 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
POLR2FP61218 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.33■■□□□ 1.97
POLR2FP61218 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
POLR2FP61218 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
POLR2FP61218 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
POLR2FP61218 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.32■■□□□ 1.96
POLR2FP61218 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
POLR2FP61218 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
POLR2FP61218 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
POLR2FP61218 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
POLR2FP61218 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
POLR2FP61218 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
POLR2FP61218 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
POLR2FP61218 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
POLR2FP61218 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
POLR2FP61218 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
POLR2FP61218 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
POLR2FP61218 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
POLR2FP61218 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
POLR2FP61218 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
POLR2FP61218 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
POLR2FP61218 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
POLR2FP61218 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
POLR2FP61218 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
POLR2FP61218 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
POLR2FP61218 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
POLR2FP61218 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
POLR2FP61218 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.27■■□□□ 1.96
POLR2FP61218 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
POLR2FP61218 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
POLR2FP61218 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
POLR2FP61218 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
POLR2FP61218 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
POLR2FP61218 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
POLR2FP61218 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
POLR2FP61218 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
POLR2FP61218 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
POLR2FP61218 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
POLR2FP61218 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
POLR2FP61218 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
POLR2FP61218 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
POLR2FP61218 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
POLR2FP61218 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 223.8 ms