Protein–RNA interactions for Protein: P61088

UBE2N, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2NP61088 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBE2NP61088 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBE2NP61088 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBE2NP61088 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBE2NP61088 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
UBE2NP61088 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBE2NP61088 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBE2NP61088 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBE2NP61088 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBE2NP61088 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBE2NP61088 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBE2NP61088 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBE2NP61088 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBE2NP61088 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBE2NP61088 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBE2NP61088 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBE2NP61088 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBE2NP61088 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBE2NP61088 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBE2NP61088 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
UBE2NP61088 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBE2NP61088 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBE2NP61088 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBE2NP61088 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
UBE2NP61088 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBE2NP61088 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBE2NP61088 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBE2NP61088 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBE2NP61088 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBE2NP61088 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBE2NP61088 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBE2NP61088 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBE2NP61088 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBE2NP61088 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBE2NP61088 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBE2NP61088 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBE2NP61088 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBE2NP61088 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
UBE2NP61088 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBE2NP61088 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBE2NP61088 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBE2NP61088 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBE2NP61088 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBE2NP61088 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBE2NP61088 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBE2NP61088 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBE2NP61088 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBE2NP61088 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBE2NP61088 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBE2NP61088 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBE2NP61088 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBE2NP61088 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBE2NP61088 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBE2NP61088 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBE2NP61088 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBE2NP61088 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBE2NP61088 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBE2NP61088 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBE2NP61088 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBE2NP61088 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBE2NP61088 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBE2NP61088 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBE2NP61088 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBE2NP61088 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBE2NP61088 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBE2NP61088 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBE2NP61088 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBE2NP61088 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBE2NP61088 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBE2NP61088 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBE2NP61088 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBE2NP61088 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBE2NP61088 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBE2NP61088 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBE2NP61088 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
UBE2NP61088 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
UBE2NP61088 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBE2NP61088 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBE2NP61088 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBE2NP61088 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBE2NP61088 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBE2NP61088 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBE2NP61088 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBE2NP61088 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBE2NP61088 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
UBE2NP61088 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBE2NP61088 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBE2NP61088 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBE2NP61088 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBE2NP61088 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
UBE2NP61088 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBE2NP61088 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBE2NP61088 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBE2NP61088 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBE2NP61088 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBE2NP61088 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBE2NP61088 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBE2NP61088 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBE2NP61088 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBE2NP61088 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms