Protein–RNA interactions for Protein: P61080

Ube2d1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d1P61080 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ube2d1P61080 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ube2d1P61080 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ube2d1P61080 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ube2d1P61080 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ube2d1P61080 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ube2d1P61080 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ube2d1P61080 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ube2d1P61080 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ube2d1P61080 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ube2d1P61080 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ube2d1P61080 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ube2d1P61080 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ube2d1P61080 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ube2d1P61080 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ube2d1P61080 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ube2d1P61080 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ube2d1P61080 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ube2d1P61080 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ube2d1P61080 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ube2d1P61080 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ube2d1P61080 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ube2d1P61080 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ube2d1P61080 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ube2d1P61080 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ube2d1P61080 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ube2d1P61080 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ube2d1P61080 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ube2d1P61080 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ube2d1P61080 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ube2d1P61080 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ube2d1P61080 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ube2d1P61080 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ube2d1P61080 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ube2d1P61080 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ube2d1P61080 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ube2d1P61080 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ube2d1P61080 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ube2d1P61080 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ube2d1P61080 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ube2d1P61080 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ube2d1P61080 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ube2d1P61080 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ube2d1P61080 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ube2d1P61080 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ube2d1P61080 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ube2d1P61080 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ube2d1P61080 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ube2d1P61080 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ube2d1P61080 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube2d1P61080 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube2d1P61080 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube2d1P61080 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube2d1P61080 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube2d1P61080 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube2d1P61080 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube2d1P61080 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube2d1P61080 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube2d1P61080 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube2d1P61080 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube2d1P61080 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube2d1P61080 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube2d1P61080 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube2d1P61080 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ube2d1P61080 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ube2d1P61080 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ube2d1P61080 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ube2d1P61080 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ube2d1P61080 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ube2d1P61080 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ube2d1P61080 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ube2d1P61080 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ube2d1P61080 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ube2d1P61080 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ube2d1P61080 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ube2d1P61080 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ube2d1P61080 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ube2d1P61080 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ube2d1P61080 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ube2d1P61080 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ube2d1P61080 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ube2d1P61080 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ube2d1P61080 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ube2d1P61080 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ube2d1P61080 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube2d1P61080 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube2d1P61080 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube2d1P61080 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube2d1P61080 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube2d1P61080 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube2d1P61080 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube2d1P61080 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube2d1P61080 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube2d1P61080 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube2d1P61080 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube2d1P61080 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube2d1P61080 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube2d1P61080 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube2d1P61080 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube2d1P61080 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms