Protein–RNA interactions for Protein: P61079

Ube2d3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D3, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d3P61079 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ube2d3P61079 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ube2d3P61079 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ube2d3P61079 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ube2d3P61079 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ube2d3P61079 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ube2d3P61079 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ube2d3P61079 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ube2d3P61079 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ube2d3P61079 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ube2d3P61079 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ube2d3P61079 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ube2d3P61079 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ube2d3P61079 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ube2d3P61079 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ube2d3P61079 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ube2d3P61079 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ube2d3P61079 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ube2d3P61079 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ube2d3P61079 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ube2d3P61079 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ube2d3P61079 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ube2d3P61079 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ube2d3P61079 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ube2d3P61079 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ube2d3P61079 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ube2d3P61079 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ube2d3P61079 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ube2d3P61079 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ube2d3P61079 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ube2d3P61079 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ube2d3P61079 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ube2d3P61079 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ube2d3P61079 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ube2d3P61079 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ube2d3P61079 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ube2d3P61079 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ube2d3P61079 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ube2d3P61079 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ube2d3P61079 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ube2d3P61079 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ube2d3P61079 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ube2d3P61079 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ube2d3P61079 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ube2d3P61079 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ube2d3P61079 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ube2d3P61079 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ube2d3P61079 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ube2d3P61079 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ube2d3P61079 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ube2d3P61079 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ube2d3P61079 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ube2d3P61079 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ube2d3P61079 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ube2d3P61079 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ube2d3P61079 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ube2d3P61079 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ube2d3P61079 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ube2d3P61079 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ube2d3P61079 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ube2d3P61079 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ube2d3P61079 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ube2d3P61079 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ube2d3P61079 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ube2d3P61079 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ube2d3P61079 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ube2d3P61079 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ube2d3P61079 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ube2d3P61079 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ube2d3P61079 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ube2d3P61079 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ube2d3P61079 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ube2d3P61079 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ube2d3P61079 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ube2d3P61079 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ube2d3P61079 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ube2d3P61079 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ube2d3P61079 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ube2d3P61079 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ube2d3P61079 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ube2d3P61079 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ube2d3P61079 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ube2d3P61079 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ube2d3P61079 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ube2d3P61079 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ube2d3P61079 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ube2d3P61079 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ube2d3P61079 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ube2d3P61079 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ube2d3P61079 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ube2d3P61079 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ube2d3P61079 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ube2d3P61079 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ube2d3P61079 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ube2d3P61079 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ube2d3P61079 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ube2d3P61079 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ube2d3P61079 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ube2d3P61079 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ube2d3P61079 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.4 ms