Protein–RNA interactions for Protein: P61014

Pln, Cardiac phospholamban, mousemouse

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PlnP61014 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PlnP61014 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PlnP61014 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PlnP61014 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PlnP61014 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PlnP61014 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PlnP61014 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PlnP61014 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PlnP61014 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PlnP61014 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PlnP61014 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PlnP61014 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PlnP61014 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PlnP61014 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PlnP61014 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PlnP61014 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PlnP61014 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PlnP61014 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PlnP61014 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PlnP61014 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PlnP61014 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PlnP61014 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PlnP61014 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PlnP61014 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PlnP61014 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PlnP61014 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PlnP61014 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PlnP61014 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PlnP61014 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PlnP61014 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PlnP61014 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PlnP61014 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PlnP61014 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PlnP61014 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PlnP61014 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PlnP61014 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PlnP61014 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PlnP61014 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PlnP61014 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PlnP61014 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PlnP61014 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PlnP61014 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PlnP61014 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PlnP61014 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PlnP61014 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PlnP61014 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PlnP61014 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PlnP61014 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PlnP61014 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PlnP61014 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PlnP61014 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PlnP61014 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PlnP61014 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PlnP61014 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PlnP61014 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PlnP61014 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PlnP61014 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PlnP61014 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PlnP61014 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PlnP61014 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PlnP61014 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PlnP61014 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PlnP61014 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PlnP61014 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PlnP61014 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PlnP61014 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PlnP61014 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PlnP61014 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PlnP61014 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PlnP61014 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PlnP61014 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PlnP61014 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PlnP61014 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PlnP61014 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PlnP61014 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PlnP61014 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PlnP61014 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PlnP61014 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PlnP61014 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PlnP61014 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PlnP61014 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PlnP61014 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PlnP61014 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PlnP61014 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PlnP61014 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PlnP61014 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PlnP61014 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PlnP61014 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PlnP61014 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PlnP61014 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PlnP61014 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PlnP61014 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PlnP61014 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PlnP61014 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PlnP61014 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PlnP61014 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PlnP61014 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PlnP61014 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PlnP61014 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PlnP61014 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms