Protein–RNA interactions for Protein: P60953

CDC42, Cell division control protein 42 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42P60953 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDC42P60953 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDC42P60953 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDC42P60953 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CDC42P60953 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDC42P60953 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDC42P60953 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDC42P60953 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDC42P60953 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDC42P60953 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDC42P60953 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDC42P60953 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDC42P60953 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDC42P60953 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDC42P60953 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDC42P60953 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDC42P60953 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDC42P60953 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDC42P60953 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDC42P60953 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CDC42P60953 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CDC42P60953 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDC42P60953 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDC42P60953 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDC42P60953 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDC42P60953 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDC42P60953 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDC42P60953 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDC42P60953 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDC42P60953 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDC42P60953 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDC42P60953 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDC42P60953 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDC42P60953 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDC42P60953 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CDC42P60953 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDC42P60953 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDC42P60953 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDC42P60953 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDC42P60953 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDC42P60953 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDC42P60953 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDC42P60953 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDC42P60953 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CDC42P60953 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDC42P60953 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDC42P60953 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDC42P60953 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDC42P60953 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDC42P60953 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDC42P60953 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDC42P60953 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
CDC42P60953 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDC42P60953 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CDC42P60953 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDC42P60953 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDC42P60953 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDC42P60953 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDC42P60953 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDC42P60953 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDC42P60953 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDC42P60953 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDC42P60953 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDC42P60953 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDC42P60953 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDC42P60953 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDC42P60953 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDC42P60953 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDC42P60953 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDC42P60953 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDC42P60953 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDC42P60953 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDC42P60953 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDC42P60953 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDC42P60953 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDC42P60953 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDC42P60953 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDC42P60953 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDC42P60953 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDC42P60953 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDC42P60953 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDC42P60953 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDC42P60953 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDC42P60953 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDC42P60953 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDC42P60953 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDC42P60953 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDC42P60953 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDC42P60953 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CDC42P60953 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDC42P60953 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDC42P60953 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDC42P60953 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDC42P60953 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDC42P60953 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CDC42P60953 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CDC42P60953 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CDC42P60953 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDC42P60953 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDC42P60953 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms