Protein–RNA interactions for Protein: P60602

ROMO1, Reactive oxygen species modulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROMO1P60602 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ROMO1P60602 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ROMO1P60602 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
ROMO1P60602 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ROMO1P60602 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ROMO1P60602 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ROMO1P60602 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ROMO1P60602 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ROMO1P60602 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ROMO1P60602 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ROMO1P60602 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ROMO1P60602 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
ROMO1P60602 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ROMO1P60602 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ROMO1P60602 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ROMO1P60602 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ROMO1P60602 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ROMO1P60602 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ROMO1P60602 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ROMO1P60602 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ROMO1P60602 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ROMO1P60602 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ROMO1P60602 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ROMO1P60602 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ROMO1P60602 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ROMO1P60602 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ROMO1P60602 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ROMO1P60602 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ROMO1P60602 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ROMO1P60602 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ROMO1P60602 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ROMO1P60602 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ROMO1P60602 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ROMO1P60602 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ROMO1P60602 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ROMO1P60602 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ROMO1P60602 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
ROMO1P60602 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ROMO1P60602 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ROMO1P60602 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ROMO1P60602 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ROMO1P60602 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ROMO1P60602 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ROMO1P60602 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
ROMO1P60602 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
ROMO1P60602 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
ROMO1P60602 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ROMO1P60602 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ROMO1P60602 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ROMO1P60602 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ROMO1P60602 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ROMO1P60602 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ROMO1P60602 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
ROMO1P60602 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ROMO1P60602 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ROMO1P60602 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ROMO1P60602 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ROMO1P60602 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ROMO1P60602 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ROMO1P60602 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ROMO1P60602 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ROMO1P60602 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ROMO1P60602 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ROMO1P60602 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ROMO1P60602 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ROMO1P60602 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ROMO1P60602 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ROMO1P60602 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ROMO1P60602 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ROMO1P60602 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ROMO1P60602 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ROMO1P60602 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ROMO1P60602 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ROMO1P60602 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ROMO1P60602 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ROMO1P60602 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ROMO1P60602 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ROMO1P60602 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ROMO1P60602 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ROMO1P60602 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ROMO1P60602 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ROMO1P60602 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ROMO1P60602 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ROMO1P60602 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ROMO1P60602 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ROMO1P60602 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ROMO1P60602 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ROMO1P60602 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ROMO1P60602 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ROMO1P60602 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ROMO1P60602 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ROMO1P60602 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ROMO1P60602 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ROMO1P60602 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ROMO1P60602 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
ROMO1P60602 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ROMO1P60602 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ROMO1P60602 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ROMO1P60602 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ROMO1P60602 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms