Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ERVPABLB-1P60509 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ERVPABLB-1P60509 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ERVPABLB-1P60509 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ERVPABLB-1P60509 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ERVPABLB-1P60509 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ERVPABLB-1P60509 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ERVPABLB-1P60509 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ERVPABLB-1P60509 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ERVPABLB-1P60509 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ERVPABLB-1P60509 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ERVPABLB-1P60509 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ERVPABLB-1P60509 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ERVPABLB-1P60509 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ERVPABLB-1P60509 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ERVPABLB-1P60509 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ERVPABLB-1P60509 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ERVPABLB-1P60509 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ERVPABLB-1P60509 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ERVPABLB-1P60509 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ERVPABLB-1P60509 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ERVPABLB-1P60509 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ERVPABLB-1P60509 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ERVPABLB-1P60509 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ERVPABLB-1P60509 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ERVPABLB-1P60509 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ERVPABLB-1P60509 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ERVPABLB-1P60509 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ERVPABLB-1P60509 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ERVPABLB-1P60509 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ERVPABLB-1P60509 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ERVPABLB-1P60509 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ERVPABLB-1P60509 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ERVPABLB-1P60509 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ERVPABLB-1P60509 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ERVPABLB-1P60509 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ERVPABLB-1P60509 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
ERVPABLB-1P60509 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ERVPABLB-1P60509 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ERVPABLB-1P60509 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ERVPABLB-1P60509 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ERVPABLB-1P60509 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ERVPABLB-1P60509 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ERVPABLB-1P60509 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ERVPABLB-1P60509 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
ERVPABLB-1P60509 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ERVPABLB-1P60509 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ERVPABLB-1P60509 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.6
ERVPABLB-1P60509 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ERVPABLB-1P60509 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ERVPABLB-1P60509 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ERVPABLB-1P60509 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ERVPABLB-1P60509 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
ERVPABLB-1P60509 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ERVPABLB-1P60509 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
ERVPABLB-1P60509 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ERVPABLB-1P60509 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ERVPABLB-1P60509 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ERVPABLB-1P60509 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ERVPABLB-1P60509 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ERVPABLB-1P60509 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ERVPABLB-1P60509 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ERVPABLB-1P60509 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ERVPABLB-1P60509 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ERVPABLB-1P60509 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ERVPABLB-1P60509 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ERVPABLB-1P60509 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ERVPABLB-1P60509 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ERVPABLB-1P60509 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ERVPABLB-1P60509 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ERVPABLB-1P60509 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ERVPABLB-1P60509 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ERVPABLB-1P60509 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ERVPABLB-1P60509 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ERVPABLB-1P60509 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ERVPABLB-1P60509 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ERVPABLB-1P60509 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ERVPABLB-1P60509 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ERVPABLB-1P60509 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ERVPABLB-1P60509 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ERVPABLB-1P60509 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ERVPABLB-1P60509 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ERVPABLB-1P60509 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ERVPABLB-1P60509 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ERVPABLB-1P60509 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ERVPABLB-1P60509 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
ERVPABLB-1P60509 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ERVPABLB-1P60509 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ERVPABLB-1P60509 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ERVPABLB-1P60509 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ERVPABLB-1P60509 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
ERVPABLB-1P60509 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ERVPABLB-1P60509 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ERVPABLB-1P60509 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ERVPABLB-1P60509 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ERVPABLB-1P60509 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ERVPABLB-1P60509 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ERVPABLB-1P60509 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ERVPABLB-1P60509 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ERVPABLB-1P60509 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.6 ms