Protein–RNA interactions for Protein: P59780

AP3S2, AP-3 complex subunit sigma-2, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3S2P59780 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
AP3S2P59780 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
AP3S2P59780 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
AP3S2P59780 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
AP3S2P59780 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
AP3S2P59780 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
AP3S2P59780 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
AP3S2P59780 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
AP3S2P59780 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
AP3S2P59780 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
AP3S2P59780 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
AP3S2P59780 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
AP3S2P59780 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
AP3S2P59780 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
AP3S2P59780 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
AP3S2P59780 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
AP3S2P59780 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
AP3S2P59780 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
AP3S2P59780 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
AP3S2P59780 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
AP3S2P59780 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
AP3S2P59780 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
AP3S2P59780 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
AP3S2P59780 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
AP3S2P59780 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
AP3S2P59780 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
AP3S2P59780 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
AP3S2P59780 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
AP3S2P59780 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
AP3S2P59780 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
AP3S2P59780 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
AP3S2P59780 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
AP3S2P59780 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
AP3S2P59780 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
AP3S2P59780 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
AP3S2P59780 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
AP3S2P59780 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
AP3S2P59780 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
AP3S2P59780 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
AP3S2P59780 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
AP3S2P59780 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
AP3S2P59780 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
AP3S2P59780 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
AP3S2P59780 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
AP3S2P59780 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
AP3S2P59780 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
AP3S2P59780 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
AP3S2P59780 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
AP3S2P59780 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
AP3S2P59780 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
AP3S2P59780 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
AP3S2P59780 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
AP3S2P59780 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
AP3S2P59780 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
AP3S2P59780 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
AP3S2P59780 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
AP3S2P59780 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
AP3S2P59780 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
AP3S2P59780 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
AP3S2P59780 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
AP3S2P59780 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
AP3S2P59780 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
AP3S2P59780 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
AP3S2P59780 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
AP3S2P59780 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
AP3S2P59780 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
AP3S2P59780 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
AP3S2P59780 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AP3S2P59780 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AP3S2P59780 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
AP3S2P59780 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
AP3S2P59780 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
AP3S2P59780 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
AP3S2P59780 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
AP3S2P59780 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
AP3S2P59780 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
AP3S2P59780 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
AP3S2P59780 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
AP3S2P59780 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
AP3S2P59780 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
AP3S2P59780 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
AP3S2P59780 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
AP3S2P59780 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
AP3S2P59780 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
AP3S2P59780 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
AP3S2P59780 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
AP3S2P59780 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
AP3S2P59780 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
AP3S2P59780 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
AP3S2P59780 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
AP3S2P59780 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
AP3S2P59780 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
AP3S2P59780 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
AP3S2P59780 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
AP3S2P59780 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
AP3S2P59780 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
AP3S2P59780 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
AP3S2P59780 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
AP3S2P59780 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
AP3S2P59780 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms