Protein–RNA interactions for Protein: P59240

Nphp4, Nephrocystin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp4P59240 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
Nphp4P59240 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC32.55■■■□□ 2.8
Nphp4P59240 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC32.54■■■□□ 2.8
Nphp4P59240 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
Nphp4P59240 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
Nphp4P59240 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Nphp4P59240 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC32.51■■■□□ 2.8
Nphp4P59240 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
Nphp4P59240 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Nphp4P59240 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Nphp4P59240 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Nphp4P59240 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Nphp4P59240 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
Nphp4P59240 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
Nphp4P59240 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Nphp4P59240 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Nphp4P59240 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Nphp4P59240 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC32.45■■■□□ 2.79
Nphp4P59240 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Nphp4P59240 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
Nphp4P59240 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Nphp4P59240 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
Nphp4P59240 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
Nphp4P59240 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Nphp4P59240 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Nphp4P59240 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
Nphp4P59240 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
Nphp4P59240 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Nphp4P59240 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Nphp4P59240 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Nphp4P59240 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
Nphp4P59240 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
Nphp4P59240 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
Nphp4P59240 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Nphp4P59240 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Nphp4P59240 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
Nphp4P59240 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Nphp4P59240 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
Nphp4P59240 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Nphp4P59240 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Nphp4P59240 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Nphp4P59240 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Nphp4P59240 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Nphp4P59240 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Nphp4P59240 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
Nphp4P59240 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
Nphp4P59240 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Nphp4P59240 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Nphp4P59240 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Nphp4P59240 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
Nphp4P59240 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Nphp4P59240 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Nphp4P59240 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC32.32■■■□□ 2.77
Nphp4P59240 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Nphp4P59240 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
Nphp4P59240 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Nphp4P59240 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC32.28■■■□□ 2.76
Nphp4P59240 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Nphp4P59240 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Nphp4P59240 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Nphp4P59240 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC32.27■■■□□ 2.76
Nphp4P59240 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Nphp4P59240 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC32.26■■■□□ 2.76
Nphp4P59240 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC32.26■■■□□ 2.76
Nphp4P59240 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.76
Nphp4P59240 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
Nphp4P59240 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC32.26■■■□□ 2.76
Nphp4P59240 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC32.26■■■□□ 2.76
Nphp4P59240 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Nphp4P59240 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Nphp4P59240 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Nphp4P59240 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Nphp4P59240 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Nphp4P59240 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Nphp4P59240 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Nphp4P59240 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
Nphp4P59240 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Nphp4P59240 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Nphp4P59240 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
Nphp4P59240 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
Nphp4P59240 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
Nphp4P59240 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Nphp4P59240 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Nphp4P59240 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Nphp4P59240 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Nphp4P59240 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Nphp4P59240 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Nphp4P59240 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Nphp4P59240 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
Nphp4P59240 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Nphp4P59240 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
Nphp4P59240 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Nphp4P59240 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Nphp4P59240 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Nphp4P59240 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Nphp4P59240 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Nphp4P59240 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Nphp4P59240 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Nphp4P59240 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Nphp4P59240 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms