Protein–RNA interactions for Protein: P59190

RAB15, Ras-related protein Rab-15, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB15P59190 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAB15P59190 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
RAB15P59190 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAB15P59190 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAB15P59190 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAB15P59190 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAB15P59190 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
RAB15P59190 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAB15P59190 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAB15P59190 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAB15P59190 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAB15P59190 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RAB15P59190 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RAB15P59190 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RAB15P59190 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
RAB15P59190 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
RAB15P59190 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
RAB15P59190 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
RAB15P59190 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAB15P59190 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAB15P59190 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAB15P59190 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAB15P59190 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RAB15P59190 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RAB15P59190 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RAB15P59190 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
RAB15P59190 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RAB15P59190 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RAB15P59190 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAB15P59190 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAB15P59190 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAB15P59190 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAB15P59190 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAB15P59190 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAB15P59190 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
RAB15P59190 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAB15P59190 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAB15P59190 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAB15P59190 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAB15P59190 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAB15P59190 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAB15P59190 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAB15P59190 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAB15P59190 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAB15P59190 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAB15P59190 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
RAB15P59190 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAB15P59190 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAB15P59190 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAB15P59190 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAB15P59190 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAB15P59190 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAB15P59190 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
RAB15P59190 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAB15P59190 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
RAB15P59190 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAB15P59190 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAB15P59190 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAB15P59190 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAB15P59190 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAB15P59190 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAB15P59190 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAB15P59190 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAB15P59190 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAB15P59190 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAB15P59190 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAB15P59190 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAB15P59190 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAB15P59190 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAB15P59190 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAB15P59190 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAB15P59190 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAB15P59190 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAB15P59190 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RAB15P59190 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RAB15P59190 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RAB15P59190 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RAB15P59190 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAB15P59190 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAB15P59190 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAB15P59190 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAB15P59190 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
RAB15P59190 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAB15P59190 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
RAB15P59190 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAB15P59190 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAB15P59190 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAB15P59190 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAB15P59190 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAB15P59190 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAB15P59190 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAB15P59190 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAB15P59190 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAB15P59190 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAB15P59190 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAB15P59190 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAB15P59190 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
RAB15P59190 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAB15P59190 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAB15P59190 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms