Protein–RNA interactions for Protein: P58873

Rhbdl3, Rhomboid-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdl3P58873 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Rhbdl3P58873 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Rhbdl3P58873 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Rhbdl3P58873 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Rhbdl3P58873 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Rhbdl3P58873 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Rhbdl3P58873 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Rhbdl3P58873 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Rhbdl3P58873 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Rhbdl3P58873 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Rhbdl3P58873 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Rhbdl3P58873 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Rhbdl3P58873 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Rhbdl3P58873 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Rhbdl3P58873 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Rhbdl3P58873 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rhbdl3P58873 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Rhbdl3P58873 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Rhbdl3P58873 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Rhbdl3P58873 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Rhbdl3P58873 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Rhbdl3P58873 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Rhbdl3P58873 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Rhbdl3P58873 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Rhbdl3P58873 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Rhbdl3P58873 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Rhbdl3P58873 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Rhbdl3P58873 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Rhbdl3P58873 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Rhbdl3P58873 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Rhbdl3P58873 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Rhbdl3P58873 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Rhbdl3P58873 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Rhbdl3P58873 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Rhbdl3P58873 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Rhbdl3P58873 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rhbdl3P58873 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rhbdl3P58873 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Rhbdl3P58873 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rhbdl3P58873 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rhbdl3P58873 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rhbdl3P58873 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rhbdl3P58873 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rhbdl3P58873 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rhbdl3P58873 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rhbdl3P58873 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rhbdl3P58873 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Rhbdl3P58873 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Rhbdl3P58873 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Rhbdl3P58873 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Rhbdl3P58873 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Rhbdl3P58873 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Rhbdl3P58873 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Rhbdl3P58873 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rhbdl3P58873 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rhbdl3P58873 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rhbdl3P58873 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Rhbdl3P58873 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rhbdl3P58873 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rhbdl3P58873 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rhbdl3P58873 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rhbdl3P58873 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rhbdl3P58873 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rhbdl3P58873 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rhbdl3P58873 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rhbdl3P58873 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rhbdl3P58873 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rhbdl3P58873 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rhbdl3P58873 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rhbdl3P58873 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rhbdl3P58873 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rhbdl3P58873 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rhbdl3P58873 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rhbdl3P58873 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Rhbdl3P58873 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Rhbdl3P58873 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rhbdl3P58873 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rhbdl3P58873 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rhbdl3P58873 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rhbdl3P58873 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rhbdl3P58873 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Rhbdl3P58873 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Rhbdl3P58873 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rhbdl3P58873 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rhbdl3P58873 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rhbdl3P58873 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rhbdl3P58873 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rhbdl3P58873 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rhbdl3P58873 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rhbdl3P58873 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rhbdl3P58873 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rhbdl3P58873 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rhbdl3P58873 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rhbdl3P58873 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rhbdl3P58873 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rhbdl3P58873 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Rhbdl3P58873 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rhbdl3P58873 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rhbdl3P58873 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rhbdl3P58873 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms