Protein–RNA interactions for Protein: P57757

Ctns, Cystinosin, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtnsP57757 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CtnsP57757 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
CtnsP57757 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CtnsP57757 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CtnsP57757 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CtnsP57757 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CtnsP57757 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CtnsP57757 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CtnsP57757 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CtnsP57757 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CtnsP57757 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CtnsP57757 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CtnsP57757 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CtnsP57757 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CtnsP57757 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CtnsP57757 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CtnsP57757 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CtnsP57757 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CtnsP57757 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CtnsP57757 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CtnsP57757 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CtnsP57757 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CtnsP57757 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CtnsP57757 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CtnsP57757 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CtnsP57757 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CtnsP57757 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CtnsP57757 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CtnsP57757 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CtnsP57757 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CtnsP57757 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CtnsP57757 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CtnsP57757 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CtnsP57757 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CtnsP57757 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CtnsP57757 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CtnsP57757 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CtnsP57757 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CtnsP57757 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CtnsP57757 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CtnsP57757 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CtnsP57757 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CtnsP57757 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CtnsP57757 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CtnsP57757 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CtnsP57757 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CtnsP57757 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CtnsP57757 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CtnsP57757 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CtnsP57757 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CtnsP57757 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CtnsP57757 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CtnsP57757 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CtnsP57757 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CtnsP57757 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CtnsP57757 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CtnsP57757 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CtnsP57757 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CtnsP57757 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CtnsP57757 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CtnsP57757 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CtnsP57757 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CtnsP57757 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CtnsP57757 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CtnsP57757 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CtnsP57757 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CtnsP57757 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CtnsP57757 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CtnsP57757 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CtnsP57757 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CtnsP57757 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CtnsP57757 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CtnsP57757 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CtnsP57757 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CtnsP57757 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CtnsP57757 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CtnsP57757 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CtnsP57757 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CtnsP57757 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CtnsP57757 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CtnsP57757 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CtnsP57757 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CtnsP57757 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CtnsP57757 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CtnsP57757 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CtnsP57757 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CtnsP57757 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CtnsP57757 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CtnsP57757 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CtnsP57757 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CtnsP57757 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CtnsP57757 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CtnsP57757 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CtnsP57757 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CtnsP57757 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CtnsP57757 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CtnsP57757 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CtnsP57757 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CtnsP57757 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CtnsP57757 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms