Protein–RNA interactions for Protein: P56393

Cox7b, Cytochrome c oxidase subunit 7B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 80 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox7bP56393 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cox7bP56393 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cox7bP56393 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cox7bP56393 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cox7bP56393 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cox7bP56393 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cox7bP56393 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cox7bP56393 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cox7bP56393 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cox7bP56393 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cox7bP56393 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cox7bP56393 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cox7bP56393 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cox7bP56393 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cox7bP56393 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cox7bP56393 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cox7bP56393 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cox7bP56393 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cox7bP56393 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cox7bP56393 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cox7bP56393 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cox7bP56393 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cox7bP56393 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cox7bP56393 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cox7bP56393 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cox7bP56393 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cox7bP56393 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cox7bP56393 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cox7bP56393 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cox7bP56393 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cox7bP56393 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cox7bP56393 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cox7bP56393 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cox7bP56393 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cox7bP56393 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cox7bP56393 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cox7bP56393 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cox7bP56393 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cox7bP56393 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cox7bP56393 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cox7bP56393 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cox7bP56393 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cox7bP56393 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cox7bP56393 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cox7bP56393 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cox7bP56393 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cox7bP56393 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cox7bP56393 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cox7bP56393 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cox7bP56393 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cox7bP56393 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cox7bP56393 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cox7bP56393 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cox7bP56393 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cox7bP56393 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cox7bP56393 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cox7bP56393 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cox7bP56393 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cox7bP56393 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cox7bP56393 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cox7bP56393 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cox7bP56393 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cox7bP56393 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cox7bP56393 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cox7bP56393 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cox7bP56393 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cox7bP56393 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cox7bP56393 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cox7bP56393 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cox7bP56393 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cox7bP56393 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cox7bP56393 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cox7bP56393 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cox7bP56393 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cox7bP56393 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cox7bP56393 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cox7bP56393 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cox7bP56393 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cox7bP56393 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cox7bP56393 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cox7bP56393 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cox7bP56393 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cox7bP56393 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cox7bP56393 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cox7bP56393 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cox7bP56393 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cox7bP56393 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cox7bP56393 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cox7bP56393 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cox7bP56393 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cox7bP56393 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cox7bP56393 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cox7bP56393 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cox7bP56393 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cox7bP56393 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cox7bP56393 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cox7bP56393 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cox7bP56393 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cox7bP56393 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cox7bP56393 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms