Protein–RNA interactions for Protein: P55895

RAG2, V(D)J recombination-activating protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAG2P55895 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAG2P55895 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAG2P55895 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAG2P55895 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAG2P55895 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAG2P55895 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAG2P55895 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAG2P55895 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAG2P55895 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAG2P55895 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAG2P55895 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAG2P55895 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAG2P55895 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAG2P55895 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAG2P55895 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAG2P55895 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAG2P55895 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAG2P55895 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAG2P55895 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAG2P55895 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAG2P55895 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAG2P55895 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAG2P55895 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAG2P55895 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
RAG2P55895 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
RAG2P55895 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
RAG2P55895 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
RAG2P55895 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAG2P55895 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAG2P55895 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAG2P55895 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAG2P55895 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAG2P55895 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAG2P55895 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAG2P55895 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
RAG2P55895 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAG2P55895 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAG2P55895 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAG2P55895 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RAG2P55895 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
RAG2P55895 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
RAG2P55895 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RAG2P55895 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAG2P55895 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAG2P55895 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAG2P55895 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAG2P55895 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAG2P55895 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
RAG2P55895 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAG2P55895 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAG2P55895 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
RAG2P55895 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAG2P55895 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAG2P55895 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAG2P55895 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAG2P55895 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAG2P55895 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
RAG2P55895 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAG2P55895 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAG2P55895 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAG2P55895 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAG2P55895 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
RAG2P55895 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAG2P55895 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAG2P55895 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAG2P55895 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAG2P55895 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAG2P55895 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAG2P55895 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAG2P55895 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAG2P55895 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAG2P55895 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAG2P55895 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAG2P55895 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAG2P55895 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAG2P55895 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAG2P55895 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAG2P55895 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAG2P55895 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAG2P55895 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAG2P55895 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAG2P55895 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAG2P55895 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAG2P55895 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAG2P55895 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAG2P55895 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAG2P55895 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAG2P55895 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAG2P55895 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAG2P55895 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAG2P55895 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
RAG2P55895 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAG2P55895 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAG2P55895 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAG2P55895 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAG2P55895 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAG2P55895 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAG2P55895 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAG2P55895 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAG2P55895 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms