Protein–RNA interactions for Protein: P55822

SH3BGR, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRP55822 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SH3BGRP55822 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SH3BGRP55822 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SH3BGRP55822 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SH3BGRP55822 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SH3BGRP55822 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SH3BGRP55822 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SH3BGRP55822 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SH3BGRP55822 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SH3BGRP55822 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SH3BGRP55822 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SH3BGRP55822 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SH3BGRP55822 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SH3BGRP55822 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SH3BGRP55822 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SH3BGRP55822 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SH3BGRP55822 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SH3BGRP55822 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SH3BGRP55822 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SH3BGRP55822 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SH3BGRP55822 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SH3BGRP55822 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SH3BGRP55822 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SH3BGRP55822 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SH3BGRP55822 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SH3BGRP55822 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SH3BGRP55822 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SH3BGRP55822 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SH3BGRP55822 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SH3BGRP55822 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SH3BGRP55822 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SH3BGRP55822 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SH3BGRP55822 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SH3BGRP55822 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SH3BGRP55822 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.39
SH3BGRP55822 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SH3BGRP55822 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SH3BGRP55822 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SH3BGRP55822 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SH3BGRP55822 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SH3BGRP55822 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SH3BGRP55822 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SH3BGRP55822 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SH3BGRP55822 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SH3BGRP55822 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SH3BGRP55822 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SH3BGRP55822 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SH3BGRP55822 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SH3BGRP55822 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SH3BGRP55822 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SH3BGRP55822 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SH3BGRP55822 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SH3BGRP55822 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SH3BGRP55822 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SH3BGRP55822 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SH3BGRP55822 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SH3BGRP55822 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SH3BGRP55822 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SH3BGRP55822 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SH3BGRP55822 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SH3BGRP55822 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SH3BGRP55822 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SH3BGRP55822 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SH3BGRP55822 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SH3BGRP55822 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SH3BGRP55822 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SH3BGRP55822 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SH3BGRP55822 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SH3BGRP55822 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SH3BGRP55822 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SH3BGRP55822 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SH3BGRP55822 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SH3BGRP55822 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SH3BGRP55822 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SH3BGRP55822 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SH3BGRP55822 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SH3BGRP55822 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SH3BGRP55822 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SH3BGRP55822 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SH3BGRP55822 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SH3BGRP55822 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SH3BGRP55822 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SH3BGRP55822 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SH3BGRP55822 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SH3BGRP55822 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SH3BGRP55822 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SH3BGRP55822 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SH3BGRP55822 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SH3BGRP55822 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SH3BGRP55822 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SH3BGRP55822 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SH3BGRP55822 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SH3BGRP55822 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SH3BGRP55822 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SH3BGRP55822 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SH3BGRP55822 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
SH3BGRP55822 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SH3BGRP55822 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SH3BGRP55822 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SH3BGRP55822 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms