Protein–RNA interactions for Protein: P55287

CDH11, Cadherin-11, humanhuman

Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH11P55287 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDH11P55287 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDH11P55287 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDH11P55287 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDH11P55287 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDH11P55287 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDH11P55287 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDH11P55287 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CDH11P55287 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CDH11P55287 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDH11P55287 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDH11P55287 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDH11P55287 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDH11P55287 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDH11P55287 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDH11P55287 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDH11P55287 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDH11P55287 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDH11P55287 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDH11P55287 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDH11P55287 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDH11P55287 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDH11P55287 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDH11P55287 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDH11P55287 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDH11P55287 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDH11P55287 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDH11P55287 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDH11P55287 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDH11P55287 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDH11P55287 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDH11P55287 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDH11P55287 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDH11P55287 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDH11P55287 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CDH11P55287 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CDH11P55287 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDH11P55287 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDH11P55287 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDH11P55287 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDH11P55287 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDH11P55287 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDH11P55287 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDH11P55287 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDH11P55287 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDH11P55287 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDH11P55287 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDH11P55287 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDH11P55287 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDH11P55287 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDH11P55287 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDH11P55287 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDH11P55287 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDH11P55287 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDH11P55287 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDH11P55287 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDH11P55287 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDH11P55287 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDH11P55287 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDH11P55287 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDH11P55287 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDH11P55287 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CDH11P55287 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDH11P55287 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDH11P55287 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDH11P55287 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDH11P55287 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDH11P55287 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDH11P55287 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDH11P55287 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CDH11P55287 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CDH11P55287 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDH11P55287 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDH11P55287 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDH11P55287 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDH11P55287 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDH11P55287 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDH11P55287 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDH11P55287 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDH11P55287 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDH11P55287 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDH11P55287 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDH11P55287 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDH11P55287 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDH11P55287 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDH11P55287 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDH11P55287 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDH11P55287 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDH11P55287 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDH11P55287 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDH11P55287 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDH11P55287 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDH11P55287 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDH11P55287 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDH11P55287 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDH11P55287 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDH11P55287 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CDH11P55287 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CDH11P55287 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDH11P55287 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms