Protein–RNA interactions for Protein: P55284

Cdh5, Cadherin-5, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh5P55284 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdh5P55284 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdh5P55284 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdh5P55284 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdh5P55284 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdh5P55284 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdh5P55284 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdh5P55284 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdh5P55284 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdh5P55284 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdh5P55284 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdh5P55284 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdh5P55284 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdh5P55284 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cdh5P55284 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cdh5P55284 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdh5P55284 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdh5P55284 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdh5P55284 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdh5P55284 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdh5P55284 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdh5P55284 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdh5P55284 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdh5P55284 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdh5P55284 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdh5P55284 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdh5P55284 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdh5P55284 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdh5P55284 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdh5P55284 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdh5P55284 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdh5P55284 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdh5P55284 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdh5P55284 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdh5P55284 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdh5P55284 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdh5P55284 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdh5P55284 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdh5P55284 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdh5P55284 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdh5P55284 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cdh5P55284 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cdh5P55284 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cdh5P55284 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Cdh5P55284 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cdh5P55284 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cdh5P55284 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cdh5P55284 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cdh5P55284 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cdh5P55284 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cdh5P55284 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cdh5P55284 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cdh5P55284 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdh5P55284 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdh5P55284 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdh5P55284 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdh5P55284 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdh5P55284 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdh5P55284 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdh5P55284 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdh5P55284 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdh5P55284 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cdh5P55284 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cdh5P55284 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cdh5P55284 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cdh5P55284 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdh5P55284 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdh5P55284 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdh5P55284 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdh5P55284 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdh5P55284 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdh5P55284 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdh5P55284 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdh5P55284 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdh5P55284 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdh5P55284 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdh5P55284 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdh5P55284 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdh5P55284 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdh5P55284 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdh5P55284 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdh5P55284 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdh5P55284 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdh5P55284 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdh5P55284 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdh5P55284 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdh5P55284 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdh5P55284 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdh5P55284 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdh5P55284 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdh5P55284 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdh5P55284 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdh5P55284 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdh5P55284 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdh5P55284 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdh5P55284 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdh5P55284 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdh5P55284 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdh5P55284 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdh5P55284 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms