Protein–RNA interactions for Protein: P55211

CASP9, Caspase-9, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9P55211 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CASP9P55211 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CASP9P55211 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CASP9P55211 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CASP9P55211 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CASP9P55211 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CASP9P55211 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CASP9P55211 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CASP9P55211 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CASP9P55211 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CASP9P55211 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CASP9P55211 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CASP9P55211 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CASP9P55211 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CASP9P55211 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CASP9P55211 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CASP9P55211 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CASP9P55211 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CASP9P55211 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CASP9P55211 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CASP9P55211 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CASP9P55211 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CASP9P55211 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CASP9P55211 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CASP9P55211 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CASP9P55211 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CASP9P55211 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CASP9P55211 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CASP9P55211 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CASP9P55211 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CASP9P55211 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CASP9P55211 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CASP9P55211 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CASP9P55211 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CASP9P55211 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CASP9P55211 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CASP9P55211 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CASP9P55211 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CASP9P55211 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CASP9P55211 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CASP9P55211 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CASP9P55211 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CASP9P55211 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CASP9P55211 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CASP9P55211 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CASP9P55211 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CASP9P55211 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CASP9P55211 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CASP9P55211 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CASP9P55211 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CASP9P55211 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CASP9P55211 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CASP9P55211 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CASP9P55211 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CASP9P55211 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CASP9P55211 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CASP9P55211 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CASP9P55211 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CASP9P55211 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CASP9P55211 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CASP9P55211 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CASP9P55211 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CASP9P55211 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CASP9P55211 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CASP9P55211 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CASP9P55211 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CASP9P55211 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CASP9P55211 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CASP9P55211 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CASP9P55211 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CASP9P55211 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CASP9P55211 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CASP9P55211 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CASP9P55211 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CASP9P55211 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CASP9P55211 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CASP9P55211 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CASP9P55211 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CASP9P55211 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CASP9P55211 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CASP9P55211 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CASP9P55211 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CASP9P55211 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CASP9P55211 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CASP9P55211 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CASP9P55211 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CASP9P55211 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CASP9P55211 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CASP9P55211 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CASP9P55211 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CASP9P55211 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CASP9P55211 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CASP9P55211 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CASP9P55211 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CASP9P55211 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CASP9P55211 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CASP9P55211 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CASP9P55211 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CASP9P55211 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CASP9P55211 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms