Protein–RNA interactions for Protein: P55087

AQP4, Aquaporin-4, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AQP4P55087 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
AQP4P55087 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
AQP4P55087 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
AQP4P55087 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
AQP4P55087 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
AQP4P55087 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
AQP4P55087 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
AQP4P55087 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
AQP4P55087 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
AQP4P55087 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
AQP4P55087 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
AQP4P55087 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
AQP4P55087 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
AQP4P55087 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
AQP4P55087 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
AQP4P55087 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
AQP4P55087 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
AQP4P55087 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
AQP4P55087 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
AQP4P55087 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
AQP4P55087 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
AQP4P55087 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
AQP4P55087 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
AQP4P55087 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
AQP4P55087 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
AQP4P55087 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
AQP4P55087 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
AQP4P55087 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
AQP4P55087 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
AQP4P55087 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
AQP4P55087 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
AQP4P55087 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
AQP4P55087 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
AQP4P55087 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
AQP4P55087 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
AQP4P55087 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
AQP4P55087 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
AQP4P55087 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
AQP4P55087 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
AQP4P55087 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
AQP4P55087 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
AQP4P55087 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
AQP4P55087 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
AQP4P55087 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
AQP4P55087 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
AQP4P55087 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
AQP4P55087 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
AQP4P55087 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
AQP4P55087 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
AQP4P55087 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
AQP4P55087 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
AQP4P55087 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
AQP4P55087 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
AQP4P55087 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
AQP4P55087 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
AQP4P55087 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
AQP4P55087 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
AQP4P55087 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
AQP4P55087 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
AQP4P55087 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
AQP4P55087 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
AQP4P55087 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
AQP4P55087 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
AQP4P55087 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
AQP4P55087 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
AQP4P55087 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
AQP4P55087 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
AQP4P55087 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
AQP4P55087 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
AQP4P55087 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
AQP4P55087 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
AQP4P55087 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
AQP4P55087 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
AQP4P55087 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
AQP4P55087 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
AQP4P55087 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
AQP4P55087 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
AQP4P55087 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
AQP4P55087 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
AQP4P55087 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
AQP4P55087 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
AQP4P55087 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
AQP4P55087 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
AQP4P55087 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
AQP4P55087 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
AQP4P55087 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
AQP4P55087 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
AQP4P55087 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
AQP4P55087 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
AQP4P55087 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
AQP4P55087 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
AQP4P55087 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
AQP4P55087 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
AQP4P55087 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
AQP4P55087 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
AQP4P55087 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
AQP4P55087 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
AQP4P55087 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
AQP4P55087 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
AQP4P55087 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms