Protein–RNA interactions for Protein: P55084

HADHB, Trifunctional enzyme subunit beta, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHBP55084 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HADHBP55084 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HADHBP55084 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HADHBP55084 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HADHBP55084 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HADHBP55084 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
HADHBP55084 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
HADHBP55084 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
HADHBP55084 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
HADHBP55084 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
HADHBP55084 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HADHBP55084 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HADHBP55084 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
HADHBP55084 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
HADHBP55084 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
HADHBP55084 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HADHBP55084 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HADHBP55084 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HADHBP55084 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HADHBP55084 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
HADHBP55084 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HADHBP55084 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HADHBP55084 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HADHBP55084 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HADHBP55084 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HADHBP55084 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HADHBP55084 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HADHBP55084 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HADHBP55084 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HADHBP55084 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HADHBP55084 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HADHBP55084 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HADHBP55084 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
HADHBP55084 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
HADHBP55084 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
HADHBP55084 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HADHBP55084 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HADHBP55084 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HADHBP55084 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HADHBP55084 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HADHBP55084 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
HADHBP55084 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HADHBP55084 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
HADHBP55084 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
HADHBP55084 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HADHBP55084 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HADHBP55084 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
HADHBP55084 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
HADHBP55084 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
HADHBP55084 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
HADHBP55084 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
HADHBP55084 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
HADHBP55084 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
HADHBP55084 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HADHBP55084 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
HADHBP55084 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.62■■□□□ 1.85
HADHBP55084 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
HADHBP55084 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HADHBP55084 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HADHBP55084 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HADHBP55084 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.61■■□□□ 1.85
HADHBP55084 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
HADHBP55084 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HADHBP55084 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HADHBP55084 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HADHBP55084 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
HADHBP55084 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
HADHBP55084 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
HADHBP55084 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
HADHBP55084 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
HADHBP55084 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HADHBP55084 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
HADHBP55084 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.58■■□□□ 1.85
HADHBP55084 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HADHBP55084 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HADHBP55084 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HADHBP55084 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
HADHBP55084 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HADHBP55084 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HADHBP55084 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HADHBP55084 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HADHBP55084 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HADHBP55084 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HADHBP55084 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HADHBP55084 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HADHBP55084 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
HADHBP55084 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HADHBP55084 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
HADHBP55084 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
HADHBP55084 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HADHBP55084 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HADHBP55084 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
HADHBP55084 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
HADHBP55084 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
HADHBP55084 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HADHBP55084 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
HADHBP55084 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
HADHBP55084 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
HADHBP55084 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
HADHBP55084 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms