Protein–RNA interactions for Protein: P54840

GYS2, Glycogen [starch] synthase, liver, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GYS2P54840 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GYS2P54840 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GYS2P54840 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GYS2P54840 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GYS2P54840 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GYS2P54840 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GYS2P54840 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GYS2P54840 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GYS2P54840 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GYS2P54840 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GYS2P54840 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GYS2P54840 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GYS2P54840 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GYS2P54840 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GYS2P54840 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GYS2P54840 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GYS2P54840 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GYS2P54840 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GYS2P54840 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GYS2P54840 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GYS2P54840 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GYS2P54840 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GYS2P54840 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GYS2P54840 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GYS2P54840 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
GYS2P54840 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GYS2P54840 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GYS2P54840 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GYS2P54840 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GYS2P54840 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GYS2P54840 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GYS2P54840 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
GYS2P54840 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GYS2P54840 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GYS2P54840 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GYS2P54840 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GYS2P54840 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GYS2P54840 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GYS2P54840 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GYS2P54840 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GYS2P54840 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GYS2P54840 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GYS2P54840 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GYS2P54840 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GYS2P54840 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GYS2P54840 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GYS2P54840 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
GYS2P54840 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GYS2P54840 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GYS2P54840 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GYS2P54840 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GYS2P54840 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GYS2P54840 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GYS2P54840 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GYS2P54840 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GYS2P54840 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GYS2P54840 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GYS2P54840 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GYS2P54840 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GYS2P54840 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GYS2P54840 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GYS2P54840 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GYS2P54840 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GYS2P54840 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GYS2P54840 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GYS2P54840 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GYS2P54840 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GYS2P54840 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GYS2P54840 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
GYS2P54840 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GYS2P54840 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GYS2P54840 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GYS2P54840 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GYS2P54840 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GYS2P54840 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GYS2P54840 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GYS2P54840 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GYS2P54840 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
GYS2P54840 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GYS2P54840 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GYS2P54840 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GYS2P54840 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GYS2P54840 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GYS2P54840 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GYS2P54840 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
GYS2P54840 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GYS2P54840 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GYS2P54840 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GYS2P54840 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GYS2P54840 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GYS2P54840 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GYS2P54840 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GYS2P54840 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GYS2P54840 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GYS2P54840 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GYS2P54840 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GYS2P54840 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GYS2P54840 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GYS2P54840 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GYS2P54840 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72 ms