Protein–RNA interactions for Protein: P54763

Ephb2, Ephrin type-B receptor 2, mousemouse

Predictions only

Length 986 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb2P54763 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ephb2P54763 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ephb2P54763 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ephb2P54763 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ephb2P54763 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ephb2P54763 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ephb2P54763 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ephb2P54763 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ephb2P54763 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ephb2P54763 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ephb2P54763 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ephb2P54763 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ephb2P54763 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ephb2P54763 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ephb2P54763 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ephb2P54763 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ephb2P54763 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ephb2P54763 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Ephb2P54763 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ephb2P54763 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ephb2P54763 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ephb2P54763 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ephb2P54763 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ephb2P54763 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ephb2P54763 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ephb2P54763 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ephb2P54763 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ephb2P54763 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ephb2P54763 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ephb2P54763 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ephb2P54763 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ephb2P54763 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ephb2P54763 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ephb2P54763 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ephb2P54763 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ephb2P54763 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ephb2P54763 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ephb2P54763 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ephb2P54763 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ephb2P54763 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ephb2P54763 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ephb2P54763 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ephb2P54763 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ephb2P54763 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ephb2P54763 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ephb2P54763 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ephb2P54763 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ephb2P54763 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ephb2P54763 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ephb2P54763 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ephb2P54763 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ephb2P54763 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ephb2P54763 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ephb2P54763 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ephb2P54763 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ephb2P54763 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ephb2P54763 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ephb2P54763 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ephb2P54763 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ephb2P54763 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ephb2P54763 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ephb2P54763 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ephb2P54763 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ephb2P54763 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ephb2P54763 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ephb2P54763 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ephb2P54763 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ephb2P54763 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ephb2P54763 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ephb2P54763 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ephb2P54763 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ephb2P54763 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ephb2P54763 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ephb2P54763 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ephb2P54763 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ephb2P54763 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ephb2P54763 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ephb2P54763 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ephb2P54763 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ephb2P54763 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ephb2P54763 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ephb2P54763 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ephb2P54763 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ephb2P54763 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ephb2P54763 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ephb2P54763 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ephb2P54763 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ephb2P54763 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ephb2P54763 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ephb2P54763 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ephb2P54763 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ephb2P54763 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ephb2P54763 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ephb2P54763 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ephb2P54763 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ephb2P54763 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Ephb2P54763 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Ephb2P54763 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ephb2P54763 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Ephb2P54763 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 383.4 ms