Protein–RNA interactions for Protein: P54284

CACNB3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB3P54284 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
CACNB3P54284 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
CACNB3P54284 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
CACNB3P54284 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
CACNB3P54284 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC30.55■■■□□ 2.48
CACNB3P54284 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CACNB3P54284 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
CACNB3P54284 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
CACNB3P54284 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
CACNB3P54284 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
CACNB3P54284 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CACNB3P54284 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
CACNB3P54284 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.48
CACNB3P54284 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
CACNB3P54284 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
CACNB3P54284 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
CACNB3P54284 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CACNB3P54284 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC30.5■■■□□ 2.47
CACNB3P54284 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
CACNB3P54284 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CACNB3P54284 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
CACNB3P54284 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CACNB3P54284 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
CACNB3P54284 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CACNB3P54284 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CACNB3P54284 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CACNB3P54284 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CACNB3P54284 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
CACNB3P54284 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
CACNB3P54284 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CACNB3P54284 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
CACNB3P54284 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
CACNB3P54284 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
CACNB3P54284 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
CACNB3P54284 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
CACNB3P54284 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
CACNB3P54284 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
CACNB3P54284 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
CACNB3P54284 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.46
CACNB3P54284 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
CACNB3P54284 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
CACNB3P54284 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
CACNB3P54284 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
CACNB3P54284 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
CACNB3P54284 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
CACNB3P54284 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
CACNB3P54284 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
CACNB3P54284 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
CACNB3P54284 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CACNB3P54284 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CACNB3P54284 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
CACNB3P54284 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CACNB3P54284 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
CACNB3P54284 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC30.41■■■□□ 2.46
CACNB3P54284 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
CACNB3P54284 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
CACNB3P54284 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
CACNB3P54284 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CACNB3P54284 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC30.39■■■□□ 2.46
CACNB3P54284 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
CACNB3P54284 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
CACNB3P54284 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
CACNB3P54284 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
CACNB3P54284 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
CACNB3P54284 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
CACNB3P54284 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
CACNB3P54284 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
CACNB3P54284 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
CACNB3P54284 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
CACNB3P54284 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
CACNB3P54284 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
CACNB3P54284 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
CACNB3P54284 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
CACNB3P54284 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
CACNB3P54284 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
CACNB3P54284 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
CACNB3P54284 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
CACNB3P54284 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC30.34■■■□□ 2.45
CACNB3P54284 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
CACNB3P54284 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
CACNB3P54284 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
CACNB3P54284 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
CACNB3P54284 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
CACNB3P54284 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
CACNB3P54284 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
CACNB3P54284 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
CACNB3P54284 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
CACNB3P54284 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
CACNB3P54284 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
CACNB3P54284 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
CACNB3P54284 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
CACNB3P54284 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
CACNB3P54284 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
CACNB3P54284 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
CACNB3P54284 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CACNB3P54284 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
CACNB3P54284 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CACNB3P54284 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
CACNB3P54284 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC30.26■■■□□ 2.43
CACNB3P54284 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms