Protein–RNA interactions for Protein: P53816

PLA2G16, HRAS-like suppressor 3, humanhuman

Predictions only

Length 162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLA2G16P53816 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PLA2G16P53816 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PLA2G16P53816 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PLA2G16P53816 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PLA2G16P53816 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PLA2G16P53816 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PLA2G16P53816 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PLA2G16P53816 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PLA2G16P53816 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PLA2G16P53816 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PLA2G16P53816 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PLA2G16P53816 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PLA2G16P53816 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
PLA2G16P53816 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PLA2G16P53816 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PLA2G16P53816 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PLA2G16P53816 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PLA2G16P53816 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PLA2G16P53816 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PLA2G16P53816 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PLA2G16P53816 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PLA2G16P53816 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PLA2G16P53816 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PLA2G16P53816 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PLA2G16P53816 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PLA2G16P53816 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PLA2G16P53816 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PLA2G16P53816 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PLA2G16P53816 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PLA2G16P53816 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PLA2G16P53816 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PLA2G16P53816 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PLA2G16P53816 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PLA2G16P53816 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PLA2G16P53816 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PLA2G16P53816 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PLA2G16P53816 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PLA2G16P53816 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PLA2G16P53816 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PLA2G16P53816 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PLA2G16P53816 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PLA2G16P53816 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PLA2G16P53816 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PLA2G16P53816 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PLA2G16P53816 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PLA2G16P53816 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PLA2G16P53816 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PLA2G16P53816 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PLA2G16P53816 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PLA2G16P53816 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PLA2G16P53816 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PLA2G16P53816 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PLA2G16P53816 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PLA2G16P53816 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PLA2G16P53816 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PLA2G16P53816 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PLA2G16P53816 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PLA2G16P53816 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PLA2G16P53816 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PLA2G16P53816 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PLA2G16P53816 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PLA2G16P53816 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PLA2G16P53816 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PLA2G16P53816 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PLA2G16P53816 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PLA2G16P53816 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PLA2G16P53816 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PLA2G16P53816 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PLA2G16P53816 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PLA2G16P53816 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PLA2G16P53816 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PLA2G16P53816 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PLA2G16P53816 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PLA2G16P53816 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PLA2G16P53816 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PLA2G16P53816 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PLA2G16P53816 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PLA2G16P53816 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PLA2G16P53816 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PLA2G16P53816 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PLA2G16P53816 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PLA2G16P53816 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PLA2G16P53816 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PLA2G16P53816 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PLA2G16P53816 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PLA2G16P53816 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PLA2G16P53816 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PLA2G16P53816 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PLA2G16P53816 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PLA2G16P53816 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PLA2G16P53816 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PLA2G16P53816 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PLA2G16P53816 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PLA2G16P53816 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PLA2G16P53816 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PLA2G16P53816 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PLA2G16P53816 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PLA2G16P53816 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PLA2G16P53816 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PLA2G16P53816 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms